Project ID: plumID:21.005
Source: CO2/plumed.dat
Originally used with PLUMED version: 2.7-mod
Stable: raw zipped stdout - stderr
Master: raw zipped stdout - stderr

# vim:ft=plumed
LOAD FILE=../codes/StructureFactor_descriptor.test.cpp
#RESTART

GROUP ATOMS=1-324:3 LABEL=C
GROUP ATOMS=2-324:3,3-324:3 LABEL=O

so: STRUCTURE_FACTOR_DESCRIPTOR_TEST ACTIVE_SHELLS=27,45,54,117,126,144 ATOMS=O 

auto1: PYTORCH_MODEL MODEL=co2_333_sfO_tc1.pt ARG=so.Sk3_-3_-3,so.Sk3_-3_3,so.Sk3_3_-3,so.Sk3_3_3,so.Sk0_3_-6,so.Sk0_3_6,so.Sk0_6_-3,so.Sk0_6_3,so.Sk3_-6_0,so.Sk3_0_-6,so.Sk3_0_6,so.Sk3_6_0,so.Sk6_-3_0,so.Sk6_0_-3,so.Sk6_0_3,so.Sk6_3_0,so.Sk3_-6_-3,so.Sk3_-6_3,so.Sk3_-3_-6,so.Sk3_-3_6,so.Sk3_3_-6,so.Sk3_3_6,so.Sk3_6_-3,so.Sk3_6_3,so.Sk6_-3_-3,so.Sk6_-3_3,so.Sk6_3_-3,so.Sk6_3_3,so.Sk0_6_-9,so.Sk0_6_9,so.Sk0_9_-6,so.Sk0_9_6,so.Sk6_-9_0,so.Sk6_0_-9,so.Sk6_0_9,so.Sk6_9_0,so.Sk9_-6_0,so.Sk9_0_-6,so.Sk9_0_6,so.Sk9_6_0,so.Sk3_-9_-6,so.Sk3_-9_6,so.Sk3_-6_-9,so.Sk3_-6_9,so.Sk3_6_-9,so.Sk3_6_9,so.Sk3_9_-6,so.Sk3_9_6,so.Sk6_-9_-3,so.Sk6_-9_3,so.Sk6_-3_-9,so.Sk6_-3_9,so.Sk6_3_-9,so.Sk6_3_9,so.Sk6_9_-3,so.Sk6_9_3,so.Sk9_-6_-3,so.Sk9_-6_3,so.Sk9_-3_-6,so.Sk9_-3_6,so.Sk9_3_-6,so.Sk9_3_6,so.Sk9_6_-3,so.Sk9_6_3,so.Sk0_0_12,so.Sk0_12_0,so.Sk12_0_0
NNcube1: MATHEVAL ARG=auto1.node-0 FUNC=x+x^3 PERIODIC=NO

OPES_METAD ...
  LABEL=opes
  ARG=NNcube1
  PACE=500
  BARRIER=200
  FILE=Kernels.data
  STATE_RFILE=compressed_KernelsR.data
  STATE_WFILE=compressed_KernelsW.data
  STATE_WSTRIDE=10000 
  NLIST
...


uwall: UPPER_WALLS ARG=NNcube1 AT=2.9 KAPPA=10000
lwall: LOWER_WALLS ARG=NNcube1 AT=-2.9 KAPPA=10000

FLUSH STRIDE=500
PRINT FMT=%g STRIDE=500 FILE=COLVAR-comps ARG=so.Sk3_-3_-3,so.Sk3_-3_3,so.Sk3_3_-3,so.Sk3_3_3,so.Sk0_3_-6,so.Sk0_3_6,so.Sk0_6_-3,so.Sk0_6_3,so.Sk3_-6_0,so.Sk3_0_-6,so.Sk3_0_6,so.Sk3_6_0,so.Sk6_-3_0,so.Sk6_0_-3,so.Sk6_0_3,so.Sk6_3_0,so.Sk3_-6_-3,so.Sk3_-6_3,so.Sk3_-3_-6,so.Sk3_-3_6,so.Sk3_3_-6,so.Sk3_3_6,so.Sk3_6_-3,so.Sk3_6_3,so.Sk6_-3_-3,so.Sk6_-3_3,so.Sk6_3_-3,so.Sk6_3_3,so.Sk0_6_-9,so.Sk0_6_9,so.Sk0_9_-6,so.Sk0_9_6,so.Sk6_-9_0,so.Sk6_0_-9,so.Sk6_0_9,so.Sk6_9_0,so.Sk9_-6_0,so.Sk9_0_-6,so.Sk9_0_6,so.Sk9_6_0,so.Sk3_-9_-6,so.Sk3_-9_6,so.Sk3_-6_-9,so.Sk3_-6_9,so.Sk3_6_-9,so.Sk3_6_9,so.Sk3_9_-6,so.Sk3_9_6,so.Sk6_-9_-3,so.Sk6_-9_3,so.Sk6_-3_-9,so.Sk6_-3_9,so.Sk6_3_-9,so.Sk6_3_9,so.Sk6_9_-3,so.Sk6_9_3,so.Sk9_-6_-3,so.Sk9_-6_3,so.Sk9_-3_-6,so.Sk9_-3_6,so.Sk9_3_-6,so.Sk9_3_6,so.Sk9_6_-3,so.Sk9_6_3,so.Sk0_0_12,so.Sk0_12_0,so.Sk12_0_0
PRINT FMT=%g STRIDE=500 FILE=COLVAR ARG=NNcube1,opes.*,uwall.*,lwall.*