PLUMED: PLUMED is starting
PLUMED: Version: 2.10.0 (git: 09264719e) compiled on Jun 10 2026 at 10:34:57
PLUMED: Please cite these papers when using PLUMED [1][2]
PLUMED: For further information see the PLUMED web page at http://www.plumed.org
PLUMED: Root: /home/runner/opt/lib/plumed
PLUMED: LibraryPath: /home/runner/opt/lib/libplumedKernel.so
PLUMED: For installed feature, see /home/runner/opt/lib/plumed/src/config/config.txt
PLUMED: Molecular dynamics engine: driver
PLUMED: Precision of reals: 8
PLUMED: Running over 1 node
PLUMED: Number of threads: 1
PLUMED: Cache line size: 512
PLUMED: Number of atoms: 1000000
PLUMED: File suffix: 
PLUMED: FILE: plumed.dat
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label HOST
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41
PLUMED:  42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66
PLUMED:  67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91
PLUMED:  92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116
PLUMED:  117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141
PLUMED:  142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166
PLUMED:  167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191
PLUMED:  192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label LIGC
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l1
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  4
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l2
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  10
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l3
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  8
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l4
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  12
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label WO
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  213 216 219 222 225 228 231 234 237 240 243 246 249 252 255 258 261 264 267 270 273 276 279 282 285
PLUMED:  288 291 294 297 300 303 306 309 312 315 318 321 324 327 330 333 336 339 342 345 348 351 354 357 360
PLUMED:  363 366 369 372 375 378 381 384 387 390 393 396 399 402 405 408 411 414 417 420 423 426 429 432 435
PLUMED:  438 441 444 447 450 453 456 459 462 465 468 471 474 477 480 483 486 489 492 495 498 501 504 507 510
PLUMED:  513 516 519 522 525 528 531 534 537 540 543 546 549 552 555 558 561 564 567 570 573 576 579 582 585
PLUMED:  588 591 594 597 600 603 606 609 612 615 618 621 624 627 630 633 636 639 642 645 648 651 654 657 660
PLUMED:  663 666 669 672 675 678 681 684 687 690 693 696 699 702 705 708 711 714 717 720 723 726 729 732 735
PLUMED:  738 741 744 747 750 753 756 759 762 765 768 771 774 777 780 783 786 789 792 795 798 801 804 807 810
PLUMED:  813 816 819 822 825 828 831 834 837 840 843 846 849 852 855 858 861 864 867 870 873 876 879 882 885
PLUMED:  888 891 894 897 900 903 906 909 912 915 918 921 924 927 930 933 936 939 942 945 948 951 954 957 960
PLUMED:  963 966 969 972 975 978 981 984 987 990 993 996 999 1002 1005 1008 1011 1014 1017 1020 1023 1026 1029 1032 1035
PLUMED:  1038 1041 1044 1047 1050 1053 1056 1059 1062 1065 1068 1071 1074 1077 1080 1083 1086 1089 1092 1095 1098 1101 1104 1107 1110
PLUMED:  1113 1116 1119 1122 1125 1128 1131 1134 1137 1140 1143 1146 1149 1152 1155 1158 1161 1164 1167 1170 1173 1176 1179 1182 1185
PLUMED:  1188 1191 1194 1197 1200 1203 1206 1209 1212 1215 1218 1221 1224 1227 1230 1233 1236 1239 1242 1245 1248 1251 1254 1257 1260
PLUMED:  1263 1266 1269 1272 1275 1278 1281 1284 1287 1290 1293 1296 1299 1302 1305 1308 1311 1314 1317 1320 1323 1326 1329 1332 1335
PLUMED:  1338 1341 1344 1347 1350 1353 1356 1359 1362 1365 1368 1371 1374 1377 1380 1383 1386 1389 1392 1395 1398 1401 1404 1407 1410
PLUMED:  1413 1416 1419 1422 1425 1428 1431 1434 1437 1440 1443 1446 1449 1452 1455 1458 1461 1464 1467 1470 1473 1476 1479 1482 1485
PLUMED:  1488 1491 1494 1497 1500 1503 1506 1509 1512 1515 1518 1521 1524 1527 1530 1533 1536 1539 1542 1545 1548 1551 1554 1557 1560
PLUMED:  1563 1566 1569 1572 1575 1578 1581 1584 1587 1590 1593 1596 1599 1602 1605 1608 1611 1614 1617 1620 1623 1626 1629 1632 1635
PLUMED:  1638 1641 1644 1647 1650 1653 1656 1659 1662 1665 1668 1671 1674 1677 1680 1683 1686 1689 1692 1695 1698 1701 1704 1707 1710
PLUMED:  1713 1716 1719 1722 1725 1728 1731 1734 1737 1740 1743 1746 1749 1752 1755 1758 1761 1764 1767 1770 1773 1776 1779 1782 1785
PLUMED:  1788 1791 1794 1797 1800 1803 1806 1809 1812 1815 1818 1821 1824 1827 1830 1833 1836 1839 1842 1845 1848 1851 1854 1857 1860
PLUMED:  1863 1866 1869 1872 1875 1878 1881 1884 1887 1890 1893 1896 1899 1902 1905 1908 1911 1914 1917 1920 1923 1926 1929 1932 1935
PLUMED:  1938 1941 1944 1947 1950 1953 1956 1959 1962 1965 1968 1971 1974 1977 1980 1983 1986 1989 1992 1995 1998 2001 2004 2007 2010
PLUMED:  2013 2016 2019 2022 2025 2028 2031 2034 2037 2040 2043 2046 2049 2052 2055 2058 2061 2064 2067 2070 2073 2076 2079 2082 2085
PLUMED:  2088 2091 2094 2097 2100 2103 2106 2109 2112 2115 2118 2121 2124 2127 2130 2133 2136 2139 2142 2145 2148 2151 2154 2157 2160
PLUMED:  2163 2166 2169 2172 2175 2178 2181 2184 2187 2190 2193 2196 2199 2202 2205 2208 2211 2214 2217 2220 2223 2226 2229 2232 2235
PLUMED:  2238 2241 2244 2247 2250 2253 2256 2259 2262 2265 2268 2271 2274 2277 2280 2283 2286 2289 2292 2295 2298 2301 2304 2307 2310
PLUMED:  2313 2316 2319 2322 2325 2328 2331 2334 2337 2340 2343 2346 2349 2352 2355 2358 2361 2364 2367 2370 2373 2376 2379 2382 2385
PLUMED:  2388 2391 2394 2397 2400 2403 2406 2409 2412 2415 2418 2421 2424 2427 2430 2433 2436 2439 2442 2445 2448 2451 2454 2457 2460
PLUMED:  2463 2466 2469 2472 2475 2478 2481 2484 2487 2490 2493 2496 2499 2502 2505 2508 2511 2514 2517 2520 2523 2526 2529 2532 2535
PLUMED:  2538 2541 2544 2547 2550 2553 2556 2559 2562 2565 2568 2571 2574 2577 2580 2583 2586 2589 2592 2595 2598 2601 2604 2607 2610
PLUMED:  2613 2616 2619 2622 2625 2628 2631 2634 2637 2640 2643 2646 2649 2652 2655 2658 2661 2664 2667 2670 2673 2676 2679 2682 2685
PLUMED:  2688 2691 2694 2697 2700 2703 2706 2709 2712 2715 2718 2721 2724 2727 2730 2733 2736 2739 2742 2745 2748 2751 2754 2757 2760
PLUMED:  2763 2766 2769 2772 2775 2778 2781 2784 2787 2790 2793 2796 2799 2802 2805 2808 2811 2814 2817 2820 2823 2826 2829 2832 2835
PLUMED:  2838 2841 2844 2847 2850 2853 2856 2859 2862 2865 2868 2871 2874 2877 2880 2883 2886 2889 2892 2895 2898 2901 2904 2907 2910
PLUMED:  2913 2916 2919 2922 2925 2928 2931 2934 2937 2940 2943 2946 2949 2952 2955 2958 2961 2964 2967 2970 2973 2976 2979 2982 2985
PLUMED:  2988 2991 2994 2997 3000 3003 3006 3009 3012 3015 3018 3021 3024 3027 3030 3033 3036 3039 3042 3045 3048 3051 3054 3057 3060
PLUMED:  3063 3066 3069 3072 3075 3078 3081 3084 3087 3090 3093 3096 3099 3102 3105 3108 3111 3114 3117 3120 3123 3126 3129 3132 3135
PLUMED:  3138 3141 3144 3147 3150 3153 3156 3159 3162 3165 3168 3171 3174 3177 3180 3183 3186 3189 3192 3195 3198 3201 3204 3207 3210
PLUMED:  3213 3216 3219 3222 3225 3228 3231 3234 3237 3240 3243 3246 3249 3252 3255 3258 3261 3264 3267 3270 3273 3276 3279 3282 3285
PLUMED:  3288 3291 3294 3297 3300 3303 3306 3309 3312 3315 3318 3321 3324 3327 3330 3333 3336 3339 3342 3345 3348 3351 3354 3357 3360
PLUMED:  3363 3366 3369 3372 3375 3378 3381 3384 3387 3390 3393 3396 3399 3402 3405 3408 3411 3414 3417 3420 3423 3426 3429 3432 3435
PLUMED:  3438 3441 3444 3447 3450 3453 3456 3459 3462 3465 3468 3471 3474 3477 3480 3483 3486 3489 3492 3495 3498 3501 3504 3507 3510
PLUMED:  3513 3516 3519 3522 3525 3528 3531 3534 3537 3540 3543 3546 3549 3552 3555 3558 3561 3564 3567 3570 3573 3576 3579 3582 3585
PLUMED:  3588 3591 3594 3597 3600 3603 3606 3609 3612 3615 3618 3621 3624 3627 3630 3633 3636 3639 3642 3645 3648 3651 3654 3657 3660
PLUMED:  3663 3666 3669 3672 3675 3678 3681 3684 3687 3690 3693 3696 3699 3702 3705 3708 3711 3714 3717 3720 3723 3726 3729 3732 3735
PLUMED:  3738 3741 3744 3747 3750 3753 3756 3759 3762 3765 3768 3771 3774 3777 3780 3783 3786 3789 3792 3795 3798 3801 3804 3807 3810
PLUMED:  3813 3816 3819 3822 3825 3828 3831 3834 3837 3840 3843 3846 3849 3852 3855 3858 3861 3864 3867 3870 3873 3876 3879 3882 3885
PLUMED:  3888 3891 3894 3897 3900 3903 3906 3909 3912 3915 3918 3921 3924 3927 3930 3933 3936 3939 3942 3945 3948 3951 3954 3957 3960
PLUMED:  3963 3966 3969 3972 3975 3978 3981 3984 3987 3990 3993 3996 3999 4002 4005 4008 4011 4014 4017 4020 4023 4026 4029 4032 4035
PLUMED:  4038 4041 4044 4047 4050 4053 4056 4059 4062 4065 4068 4071 4074 4077 4080 4083 4086 4089 4092 4095 4098 4101 4104 4107 4110
PLUMED:  4113 4116 4119 4122 4125 4128 4131 4134 4137 4140 4143 4146 4149 4152 4155 4158 4161 4164 4167 4170 4173 4176 4179 4182 4185
PLUMED:  4188 4191 4194 4197 4200 4203 4206 4209 4212 4215 4218 4221 4224 4227 4230 4233 4236 4239 4242 4245 4248 4251 4254 4257 4260
PLUMED:  4263 4266 4269 4272 4275 4278 4281 4284 4287 4290 4293 4296 4299 4302 4305 4308 4311 4314 4317 4320 4323 4326 4329 4332 4335
PLUMED:  4338 4341 4344 4347 4350 4353 4356 4359 4362 4365 4368 4371 4374 4377 4380 4383 4386 4389 4392 4395 4398 4401 4404 4407 4410
PLUMED:  4413 4416 4419 4422 4425 4428 4431 4434 4437 4440 4443 4446 4449 4452 4455 4458 4461 4464 4467 4470 4473 4476 4479 4482 4485
PLUMED:  4488 4491 4494 4497 4500 4503 4506 4509 4512 4515 4518 4521 4524 4527 4530 4533 4536 4539 4542 4545 4548 4551 4554 4557 4560
PLUMED:  4563 4566 4569 4572 4575 4578 4581 4584 4587 4590 4593 4596 4599 4602 4605 4608 4611 4614 4617 4620 4623 4626 4629 4632 4635
PLUMED:  4638 4641 4644 4647 4650 4653 4656 4659 4662 4665 4668 4671 4674 4677 4680 4683 4686 4689 4692 4695 4698 4701 4704 4707 4710
PLUMED:  4713 4716 4719 4722 4725 4728 4731 4734 4737 4740 4743 4746 4749 4752 4755 4758 4761 4764 4767 4770 4773 4776 4779 4782 4785
PLUMED:  4788 4791 4794 4797 4800 4803 4806 4809 4812 4815 4818 4821 4824 4827 4830 4833 4836 4839 4842 4845 4848 4851 4854 4857 4860
PLUMED:  4863 4866 4869 4872 4875 4878 4881 4884 4887 4890 4893 4896 4899 4902 4905 4908 4911 4914 4917 4920 4923 4926 4929 4932 4935
PLUMED:  4938 4941 4944 4947 4950 4953 4956 4959 4962 4965 4968 4971 4974 4977 4980 4983 4986 4989 4992 4995 4998 5001 5004 5007 5010
PLUMED:  5013 5016 5019 5022 5025 5028 5031 5034 5037 5040 5043 5046 5049 5052 5055 5058 5061 5064 5067 5070 5073 5076 5079 5082 5085
PLUMED:  5088 5091 5094 5097 5100 5103 5106 5109 5112 5115 5118 5121 5124 5127 5130 5133 5136 5139 5142 5145 5148 5151 5154 5157 5160
PLUMED:  5163 5166 5169 5172 5175 5178 5181 5184 5187 5190 5193 5196 5199 5202 5205 5208 5211 5214 5217 5220 5223 5226 5229 5232 5235
PLUMED:  5238 5241 5244 5247 5250 5253 5256 5259 5262 5265 5268 5271 5274 5277 5280 5283 5286 5289 5292 5295 5298 5301 5304 5307 5310
PLUMED:  5313 5316 5319 5322 5325 5328 5331 5334 5337 5340 5343 5346 5349 5352 5355 5358 5361 5364 5367 5370 5373 5376 5379 5382 5385
PLUMED:  5388 5391 5394 5397 5400 5403 5406 5409 5412 5415 5418 5421 5424 5427 5430 5433 5436 5439 5442 5445 5448 5451 5454 5457 5460
PLUMED:  5463 5466 5469 5472 5475 5478 5481 5484 5487 5490 5493 5496 5499 5502 5505 5508 5511 5514 5517 5520 5523 5526 5529 5532 5535
PLUMED:  5538 5541 5544 5547 5550 5553 5556 5559 5562 5565 5568 5571 5574 5577 5580 5583 5586 5589 5592 5595 5598 5601 5604 5607 5610
PLUMED:  5613 5616 5619 5622 5625 5628 5631 5634 5637 5640 5643 5646 5649 5652 5655 5658 5661 5664 5667 5670 5673 5676 5679 5682 5685
PLUMED:  5688 5691 5694 5697 5700 5703 5706 5709 5712 5715 5718 5721 5724 5727 5730 5733 5736 5739 5742 5745 5748 5751 5754 5757 5760
PLUMED:  5763 5766 5769 5772 5775 5778 5781 5784 5787 5790 5793 5796 5799 5802 5805 5808 5811 5814 5817 5820 5823 5826 5829 5832 5835
PLUMED:  5838 5841 5844 5847 5850 5853 5856 5859 5862 5865 5868 5871 5874 5877 5880 5883 5886 5889 5892 5895 5898 5901 5904 5907 5910
PLUMED:  5913 5916 5919 5922 5925 5928 5931 5934 5937 5940 5943 5946 5949 5952 5955 5958 5961 5964 5967 5970 5973 5976 5979 5982 5985
PLUMED:  5988 5991 5994 5997 6000 6003 6006 6009 6012 6015 6018 6021 6024 6027 6030 6033 6036 6039 6042 6045 6048 6051 6054 6057 6060
PLUMED:  6063 6066 6069 6072 6075 6078 6081 6084 6087 6090 6093 6096 6099 6102 6105 6108 6111 6114 6117 6120 6123 6126 6129 6132 6135
PLUMED:  6138 6141 6144 6147 6150 6153 6156 6159 6162 6165 6168 6171 6174 6177 6180 6183 6186 6189 6192 6195 6198 6201 6204 6207 6210
PLUMED:  6213 6216 6219 6222 6225 6228 6231 6234 6237 6240 6243 6246 6249 6252 6255 6258 6261 6264 6267 6270 6273 6276 6279 6282 6285
PLUMED:  6288 6291 6294 6297 6300 6303 6306 6309 6312 6315 6318 6321 6324 6327 6330 6333 6336 6339 6342 6345 6348 6351 6354 6357 6360
PLUMED:  6363 6366 6369 6372 6375 6378 6381 6384 6387 6390 6393 6396 6399 6402 6405 6408 6411 6414 6417 6420 6423 6426 6429 6432 6435
PLUMED:  6438 6441 6444 6447 6450 6453 6456 6459 6462 6465 6468 6471 6474 6477 6480 6483 6486 6489 6492 6495 6498 6501 6504 6507 6510
PLUMED:  6513 6516 6519 6522 6525 6528 6531 6534 6537 6540 6543 6546 6549 6552 6555 6558 6561 6564 6567 6570 6573 6576 6579 6582 6585
PLUMED:  6588 6591 6594 6597 6600 6603 6606 6609 6612 6615 6618 6621 6624 6627 6630 6633 6636 6639 6642 6645 6648 6651 6654 6657 6660
PLUMED:  6663 6666 6669 6672 6675 6678 6681 6684 6687 6690 6693 6696 6699 6702 6705 6708 6711 6714 6717 6720 6723 6726 6729 6732 6735
PLUMED:  6738 6741 6744 6747 6750 6753 6756 6759 6762 6765 6768 6771 6774 6777 6780 6783 6786 6789 6792 6795 6798 6801 6804 6807 6810
PLUMED:  6813 6816 6819 6822 6825 6828 6831
PLUMED: Action WHOLEMOLECULES
PLUMED:   with label @7
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   atoms in entity 0 : 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 
PLUMED: Action FIT_TO_TEMPLATE
PLUMED:   with label @8
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   found 40 atoms in input 
PLUMED:   with indices : 
PLUMED: 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 
PLUMED: 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 
PLUMED:   Method chosen for fitting: OPTIMAL 
PLUMED: WARNING for action FIT_TO_TEMPLATE with label @8 : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED: Action CENTER
PLUMED:   with label lig
PLUMED: Action CENTER_FAST
PLUMED:   with label lig
PLUMED:   added component to this action:  lig.x 
PLUMED:   added component to this action:  lig.y 
PLUMED:   added component to this action:  lig.z 
PLUMED:   added component to this action:  lig.mass 
PLUMED:   added component to this action:  lig.charge 
PLUMED:   of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
PLUMED:  using the geometric center
PLUMED:   broken molecules will be rebuilt assuming atoms are in the proper order
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v1
PLUMED:   added component to this action:  v1.x 
PLUMED:   added component to this action:  v1.y 
PLUMED:   added component to this action:  v1.z 
PLUMED:   added component to this action:  v1.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v1.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v2
PLUMED:   added component to this action:  v2.x 
PLUMED:   added component to this action:  v2.y 
PLUMED:   added component to this action:  v2.z 
PLUMED:   added component to this action:  v2.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v2.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v3
PLUMED:   added component to this action:  v3.x 
PLUMED:   added component to this action:  v3.y 
PLUMED:   added component to this action:  v3.z 
PLUMED:   added component to this action:  v3.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v3.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v4
PLUMED:   added component to this action:  v4.x 
PLUMED:   added component to this action:  v4.y 
PLUMED:   added component to this action:  v4.z 
PLUMED:   added component to this action:  v4.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v4.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.75
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v5
PLUMED:   added component to this action:  v5.x 
PLUMED:   added component to this action:  v5.y 
PLUMED:   added component to this action:  v5.z 
PLUMED:   added component to this action:  v5.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v5.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v6
PLUMED:   added component to this action:  v6.x 
PLUMED:   added component to this action:  v6.y 
PLUMED:   added component to this action:  v6.z 
PLUMED:   added component to this action:  v6.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v6.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v7
PLUMED:   added component to this action:  v7.x 
PLUMED:   added component to this action:  v7.y 
PLUMED:   added component to this action:  v7.z 
PLUMED:   added component to this action:  v7.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v7.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v8
PLUMED:   added component to this action:  v8.x 
PLUMED:   added component to this action:  v8.y 
PLUMED:   added component to this action:  v8.z 
PLUMED:   added component to this action:  v8.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v8.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.75
PLUMED: Action DISTANCE
PLUMED:   with label cyl
PLUMED:   between atoms 1000002 1000001
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   added component to this action:  cyl.x 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.y 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.z 
PLUMED:   WARNING: components will not have the proper periodicity - see manual
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label radius
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.x 
PLUMED:    scalar with label cyl.y 
PLUMED:   with function : sqrt(x*x+y*y)
PLUMED:   with variables : x y
PLUMED:   function as parsed by lepton: sqrt((square(x))+(square(y)))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((x)+(x))
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((y)+(y))
PLUMED:   not calculating when all arguments are zero 
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   4  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   10  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000003  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   8  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   12  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000002  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000004  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000005  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V5
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000006  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V6
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000007  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V7
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000008  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V8
PLUMED:   between two groups of 1 and 2207 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000009  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   213  216  219  222  225  228  231  234  237  240  243  246  249  252  255  258  261  264  267  270  273  276  279  282  
PLUMED:   285  288  291  294  297  300  303  306  309  312  315  318  321  324  327  330  333  336  339  342  345  348  351  354  357  
PLUMED:   360  363  366  369  372  375  378  381  384  387  390  393  396  399  402  405  408  411  414  417  420  423  426  429  432  
PLUMED:   435  438  441  444  447  450  453  456  459  462  465  468  471  474  477  480  483  486  489  492  495  498  501  504  507  
PLUMED:   510  513  516  519  522  525  528  531  534  537  540  543  546  549  552  555  558  561  564  567  570  573  576  579  582  
PLUMED:   585  588  591  594  597  600  603  606  609  612  615  618  621  624  627  630  633  636  639  642  645  648  651  654  657  
PLUMED:   660  663  666  669  672  675  678  681  684  687  690  693  696  699  702  705  708  711  714  717  720  723  726  729  732  
PLUMED:   735  738  741  744  747  750  753  756  759  762  765  768  771  774  777  780  783  786  789  792  795  798  801  804  807  
PLUMED:   810  813  816  819  822  825  828  831  834  837  840  843  846  849  852  855  858  861  864  867  870  873  876  879  882  
PLUMED:   885  888  891  894  897  900  903  906  909  912  915  918  921  924  927  930  933  936  939  942  945  948  951  954  957  
PLUMED:   960  963  966  969  972  975  978  981  984  987  990  993  996  999  1002  1005  1008  1011  1014  1017  1020  1023  1026  1029  1032  
PLUMED:   1035  1038  1041  1044  1047  1050  1053  1056  1059  1062  1065  1068  1071  1074  1077  1080  1083  1086  1089  1092  1095  1098  1101  1104  1107  
PLUMED:   1110  1113  1116  1119  1122  1125  1128  1131  1134  1137  1140  1143  1146  1149  1152  1155  1158  1161  1164  1167  1170  1173  1176  1179  1182  
PLUMED:   1185  1188  1191  1194  1197  1200  1203  1206  1209  1212  1215  1218  1221  1224  1227  1230  1233  1236  1239  1242  1245  1248  1251  1254  1257  
PLUMED:   1260  1263  1266  1269  1272  1275  1278  1281  1284  1287  1290  1293  1296  1299  1302  1305  1308  1311  1314  1317  1320  1323  1326  1329  1332  
PLUMED:   1335  1338  1341  1344  1347  1350  1353  1356  1359  1362  1365  1368  1371  1374  1377  1380  1383  1386  1389  1392  1395  1398  1401  1404  1407  
PLUMED:   1410  1413  1416  1419  1422  1425  1428  1431  1434  1437  1440  1443  1446  1449  1452  1455  1458  1461  1464  1467  1470  1473  1476  1479  1482  
PLUMED:   1485  1488  1491  1494  1497  1500  1503  1506  1509  1512  1515  1518  1521  1524  1527  1530  1533  1536  1539  1542  1545  1548  1551  1554  1557  
PLUMED:   1560  1563  1566  1569  1572  1575  1578  1581  1584  1587  1590  1593  1596  1599  1602  1605  1608  1611  1614  1617  1620  1623  1626  1629  1632  
PLUMED:   1635  1638  1641  1644  1647  1650  1653  1656  1659  1662  1665  1668  1671  1674  1677  1680  1683  1686  1689  1692  1695  1698  1701  1704  1707  
PLUMED:   1710  1713  1716  1719  1722  1725  1728  1731  1734  1737  1740  1743  1746  1749  1752  1755  1758  1761  1764  1767  1770  1773  1776  1779  1782  
PLUMED:   1785  1788  1791  1794  1797  1800  1803  1806  1809  1812  1815  1818  1821  1824  1827  1830  1833  1836  1839  1842  1845  1848  1851  1854  1857  
PLUMED:   1860  1863  1866  1869  1872  1875  1878  1881  1884  1887  1890  1893  1896  1899  1902  1905  1908  1911  1914  1917  1920  1923  1926  1929  1932  
PLUMED:   1935  1938  1941  1944  1947  1950  1953  1956  1959  1962  1965  1968  1971  1974  1977  1980  1983  1986  1989  1992  1995  1998  2001  2004  2007  
PLUMED:   2010  2013  2016  2019  2022  2025  2028  2031  2034  2037  2040  2043  2046  2049  2052  2055  2058  2061  2064  2067  2070  2073  2076  2079  2082  
PLUMED:   2085  2088  2091  2094  2097  2100  2103  2106  2109  2112  2115  2118  2121  2124  2127  2130  2133  2136  2139  2142  2145  2148  2151  2154  2157  
PLUMED:   2160  2163  2166  2169  2172  2175  2178  2181  2184  2187  2190  2193  2196  2199  2202  2205  2208  2211  2214  2217  2220  2223  2226  2229  2232  
PLUMED:   2235  2238  2241  2244  2247  2250  2253  2256  2259  2262  2265  2268  2271  2274  2277  2280  2283  2286  2289  2292  2295  2298  2301  2304  2307  
PLUMED:   2310  2313  2316  2319  2322  2325  2328  2331  2334  2337  2340  2343  2346  2349  2352  2355  2358  2361  2364  2367  2370  2373  2376  2379  2382  
PLUMED:   2385  2388  2391  2394  2397  2400  2403  2406  2409  2412  2415  2418  2421  2424  2427  2430  2433  2436  2439  2442  2445  2448  2451  2454  2457  
PLUMED:   2460  2463  2466  2469  2472  2475  2478  2481  2484  2487  2490  2493  2496  2499  2502  2505  2508  2511  2514  2517  2520  2523  2526  2529  2532  
PLUMED:   2535  2538  2541  2544  2547  2550  2553  2556  2559  2562  2565  2568  2571  2574  2577  2580  2583  2586  2589  2592  2595  2598  2601  2604  2607  
PLUMED:   2610  2613  2616  2619  2622  2625  2628  2631  2634  2637  2640  2643  2646  2649  2652  2655  2658  2661  2664  2667  2670  2673  2676  2679  2682  
PLUMED:   2685  2688  2691  2694  2697  2700  2703  2706  2709  2712  2715  2718  2721  2724  2727  2730  2733  2736  2739  2742  2745  2748  2751  2754  2757  
PLUMED:   2760  2763  2766  2769  2772  2775  2778  2781  2784  2787  2790  2793  2796  2799  2802  2805  2808  2811  2814  2817  2820  2823  2826  2829  2832  
PLUMED:   2835  2838  2841  2844  2847  2850  2853  2856  2859  2862  2865  2868  2871  2874  2877  2880  2883  2886  2889  2892  2895  2898  2901  2904  2907  
PLUMED:   2910  2913  2916  2919  2922  2925  2928  2931  2934  2937  2940  2943  2946  2949  2952  2955  2958  2961  2964  2967  2970  2973  2976  2979  2982  
PLUMED:   2985  2988  2991  2994  2997  3000  3003  3006  3009  3012  3015  3018  3021  3024  3027  3030  3033  3036  3039  3042  3045  3048  3051  3054  3057  
PLUMED:   3060  3063  3066  3069  3072  3075  3078  3081  3084  3087  3090  3093  3096  3099  3102  3105  3108  3111  3114  3117  3120  3123  3126  3129  3132  
PLUMED:   3135  3138  3141  3144  3147  3150  3153  3156  3159  3162  3165  3168  3171  3174  3177  3180  3183  3186  3189  3192  3195  3198  3201  3204  3207  
PLUMED:   3210  3213  3216  3219  3222  3225  3228  3231  3234  3237  3240  3243  3246  3249  3252  3255  3258  3261  3264  3267  3270  3273  3276  3279  3282  
PLUMED:   3285  3288  3291  3294  3297  3300  3303  3306  3309  3312  3315  3318  3321  3324  3327  3330  3333  3336  3339  3342  3345  3348  3351  3354  3357  
PLUMED:   3360  3363  3366  3369  3372  3375  3378  3381  3384  3387  3390  3393  3396  3399  3402  3405  3408  3411  3414  3417  3420  3423  3426  3429  3432  
PLUMED:   3435  3438  3441  3444  3447  3450  3453  3456  3459  3462  3465  3468  3471  3474  3477  3480  3483  3486  3489  3492  3495  3498  3501  3504  3507  
PLUMED:   3510  3513  3516  3519  3522  3525  3528  3531  3534  3537  3540  3543  3546  3549  3552  3555  3558  3561  3564  3567  3570  3573  3576  3579  3582  
PLUMED:   3585  3588  3591  3594  3597  3600  3603  3606  3609  3612  3615  3618  3621  3624  3627  3630  3633  3636  3639  3642  3645  3648  3651  3654  3657  
PLUMED:   3660  3663  3666  3669  3672  3675  3678  3681  3684  3687  3690  3693  3696  3699  3702  3705  3708  3711  3714  3717  3720  3723  3726  3729  3732  
PLUMED:   3735  3738  3741  3744  3747  3750  3753  3756  3759  3762  3765  3768  3771  3774  3777  3780  3783  3786  3789  3792  3795  3798  3801  3804  3807  
PLUMED:   3810  3813  3816  3819  3822  3825  3828  3831  3834  3837  3840  3843  3846  3849  3852  3855  3858  3861  3864  3867  3870  3873  3876  3879  3882  
PLUMED:   3885  3888  3891  3894  3897  3900  3903  3906  3909  3912  3915  3918  3921  3924  3927  3930  3933  3936  3939  3942  3945  3948  3951  3954  3957  
PLUMED:   3960  3963  3966  3969  3972  3975  3978  3981  3984  3987  3990  3993  3996  3999  4002  4005  4008  4011  4014  4017  4020  4023  4026  4029  4032  
PLUMED:   4035  4038  4041  4044  4047  4050  4053  4056  4059  4062  4065  4068  4071  4074  4077  4080  4083  4086  4089  4092  4095  4098  4101  4104  4107  
PLUMED:   4110  4113  4116  4119  4122  4125  4128  4131  4134  4137  4140  4143  4146  4149  4152  4155  4158  4161  4164  4167  4170  4173  4176  4179  4182  
PLUMED:   4185  4188  4191  4194  4197  4200  4203  4206  4209  4212  4215  4218  4221  4224  4227  4230  4233  4236  4239  4242  4245  4248  4251  4254  4257  
PLUMED:   4260  4263  4266  4269  4272  4275  4278  4281  4284  4287  4290  4293  4296  4299  4302  4305  4308  4311  4314  4317  4320  4323  4326  4329  4332  
PLUMED:   4335  4338  4341  4344  4347  4350  4353  4356  4359  4362  4365  4368  4371  4374  4377  4380  4383  4386  4389  4392  4395  4398  4401  4404  4407  
PLUMED:   4410  4413  4416  4419  4422  4425  4428  4431  4434  4437  4440  4443  4446  4449  4452  4455  4458  4461  4464  4467  4470  4473  4476  4479  4482  
PLUMED:   4485  4488  4491  4494  4497  4500  4503  4506  4509  4512  4515  4518  4521  4524  4527  4530  4533  4536  4539  4542  4545  4548  4551  4554  4557  
PLUMED:   4560  4563  4566  4569  4572  4575  4578  4581  4584  4587  4590  4593  4596  4599  4602  4605  4608  4611  4614  4617  4620  4623  4626  4629  4632  
PLUMED:   4635  4638  4641  4644  4647  4650  4653  4656  4659  4662  4665  4668  4671  4674  4677  4680  4683  4686  4689  4692  4695  4698  4701  4704  4707  
PLUMED:   4710  4713  4716  4719  4722  4725  4728  4731  4734  4737  4740  4743  4746  4749  4752  4755  4758  4761  4764  4767  4770  4773  4776  4779  4782  
PLUMED:   4785  4788  4791  4794  4797  4800  4803  4806  4809  4812  4815  4818  4821  4824  4827  4830  4833  4836  4839  4842  4845  4848  4851  4854  4857  
PLUMED:   4860  4863  4866  4869  4872  4875  4878  4881  4884  4887  4890  4893  4896  4899  4902  4905  4908  4911  4914  4917  4920  4923  4926  4929  4932  
PLUMED:   4935  4938  4941  4944  4947  4950  4953  4956  4959  4962  4965  4968  4971  4974  4977  4980  4983  4986  4989  4992  4995  4998  5001  5004  5007  
PLUMED:   5010  5013  5016  5019  5022  5025  5028  5031  5034  5037  5040  5043  5046  5049  5052  5055  5058  5061  5064  5067  5070  5073  5076  5079  5082  
PLUMED:   5085  5088  5091  5094  5097  5100  5103  5106  5109  5112  5115  5118  5121  5124  5127  5130  5133  5136  5139  5142  5145  5148  5151  5154  5157  
PLUMED:   5160  5163  5166  5169  5172  5175  5178  5181  5184  5187  5190  5193  5196  5199  5202  5205  5208  5211  5214  5217  5220  5223  5226  5229  5232  
PLUMED:   5235  5238  5241  5244  5247  5250  5253  5256  5259  5262  5265  5268  5271  5274  5277  5280  5283  5286  5289  5292  5295  5298  5301  5304  5307  
PLUMED:   5310  5313  5316  5319  5322  5325  5328  5331  5334  5337  5340  5343  5346  5349  5352  5355  5358  5361  5364  5367  5370  5373  5376  5379  5382  
PLUMED:   5385  5388  5391  5394  5397  5400  5403  5406  5409  5412  5415  5418  5421  5424  5427  5430  5433  5436  5439  5442  5445  5448  5451  5454  5457  
PLUMED:   5460  5463  5466  5469  5472  5475  5478  5481  5484  5487  5490  5493  5496  5499  5502  5505  5508  5511  5514  5517  5520  5523  5526  5529  5532  
PLUMED:   5535  5538  5541  5544  5547  5550  5553  5556  5559  5562  5565  5568  5571  5574  5577  5580  5583  5586  5589  5592  5595  5598  5601  5604  5607  
PLUMED:   5610  5613  5616  5619  5622  5625  5628  5631  5634  5637  5640  5643  5646  5649  5652  5655  5658  5661  5664  5667  5670  5673  5676  5679  5682  
PLUMED:   5685  5688  5691  5694  5697  5700  5703  5706  5709  5712  5715  5718  5721  5724  5727  5730  5733  5736  5739  5742  5745  5748  5751  5754  5757  
PLUMED:   5760  5763  5766  5769  5772  5775  5778  5781  5784  5787  5790  5793  5796  5799  5802  5805  5808  5811  5814  5817  5820  5823  5826  5829  5832  
PLUMED:   5835  5838  5841  5844  5847  5850  5853  5856  5859  5862  5865  5868  5871  5874  5877  5880  5883  5886  5889  5892  5895  5898  5901  5904  5907  
PLUMED:   5910  5913  5916  5919  5922  5925  5928  5931  5934  5937  5940  5943  5946  5949  5952  5955  5958  5961  5964  5967  5970  5973  5976  5979  5982  
PLUMED:   5985  5988  5991  5994  5997  6000  6003  6006  6009  6012  6015  6018  6021  6024  6027  6030  6033  6036  6039  6042  6045  6048  6051  6054  6057  
PLUMED:   6060  6063  6066  6069  6072  6075  6078  6081  6084  6087  6090  6093  6096  6099  6102  6105  6108  6111  6114  6117  6120  6123  6126  6129  6132  
PLUMED:   6135  6138  6141  6144  6147  6150  6153  6156  6159  6162  6165  6168  6171  6174  6177  6180  6183  6186  6189  6192  6195  6198  6201  6204  6207  
PLUMED:   6210  6213  6216  6219  6222  6225  6228  6231  6234  6237  6240  6243  6246  6249  6252  6255  6258  6261  6264  6267  6270  6273  6276  6279  6282  
PLUMED:   6285  6288  6291  6294  6297  6300  6303  6306  6309  6312  6315  6318  6321  6324  6327  6330  6333  6336  6339  6342  6345  6348  6351  6354  6357  
PLUMED:   6360  6363  6366  6369  6372  6375  6378  6381  6384  6387  6390  6393  6396  6399  6402  6405  6408  6411  6414  6417  6420  6423  6426  6429  6432  
PLUMED:   6435  6438  6441  6444  6447  6450  6453  6456  6459  6462  6465  6468  6471  6474  6477  6480  6483  6486  6489  6492  6495  6498  6501  6504  6507  
PLUMED:   6510  6513  6516  6519  6522  6525  6528  6531  6534  6537  6540  6543  6546  6549  6552  6555  6558  6561  6564  6567  6570  6573  6576  6579  6582  
PLUMED:   6585  6588  6591  6594  6597  6600  6603  6606  6609  6612  6615  6618  6621  6624  6627  6630  6633  6636  6639  6642  6645  6648  6651  6654  6657  
PLUMED:   6660  6663  6666  6669  6672  6675  6678  6681  6684  6687  6690  6693  6696  6699  6702  6705  6708  6711  6714  6717  6720  6723  6726  6729  6732  
PLUMED:   6735  6738  6741  6744  6747  6750  6753  6756  6759  6762  6765  6768  6771  6774  6777  6780  6783  6786  6789  6792  6795  6798  6801  6804  6807  
PLUMED:   6810  6813  6816  6819  6822  6825  6828  6831  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action ANGLE
PLUMED:   with label ang
PLUMED:   between lines 1000004-1000006 and 2-12
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label cosang
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label ang 
PLUMED:   with function : cos(x)
PLUMED:   with variables : x
PLUMED:   function as parsed by lepton: cos(x)
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     -(sin(x))
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label funnel
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   with function : (r+1.0*(-1.2+z))*step(-z+1.)+(r-0.2)*step(z-1.)
PLUMED:   with variables : r z
PLUMED:   function as parsed by lepton: (((r)+(-1.2+(z)))*(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(step(-1+(z))))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+(((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))+(step(-1+(z))))
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label funnelwall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label funnel 
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.bias 
PLUMED:   at 0.000000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 2000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.force2 
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label upper_wall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.bias 
PLUMED:   at 1.800000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 4000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.force2 
PLUMED: Action ENERGY
PLUMED:   with label ene
PLUMED: WARNING for action ENERGY with label ene : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED:   Bibliography [3][4]
PLUMED: Action OPES_METAD_EXPLORE
PLUMED:   with label opes
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:   added component to this action:  opes.bias 
PLUMED:  +++ WARNING +++ the provided STATE_RFILE will be ignored, since RESTART was not requested
PLUMED:   added component to this action:  opes.rct 
PLUMED:   added component to this action:  opes.zed 
PLUMED:   added component to this action:  opes.neff 
PLUMED:   added component to this action:  opes.nker 
PLUMED:   temperature = 299.478
PLUMED:   beta = 0.401606
PLUMED:   depositing new kernels with PACE = 10000
PLUMED:   expected BARRIER is 50
PLUMED:   using target distribution with BIASFACTOR gamma = 20.0803
PLUMED:   adaptive SIGMA will be used, with ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE = 100000
PLUMED:     thus the first x kernel depositions will be skipped, x = ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE/PACE = 10
PLUMED:   kernels are truncated with KERNELS_CUTOFF = 6.33724
PLUMED:   the value at cutoff is = 1.90207e-09
PLUMED:   regularization EPSILON = 0.349095
PLUMED:   kernels will be compressed when closer than COMPRESSION_THRESHOLD = 1
PLUMED:   state checkpoints are written on file compressed.Kernels.data only on CPT events (or never if MD code does define them!)
PLUMED:   Bibliography: [5][6]
PLUMED: Action PRINT
PLUMED:   with label @46
PLUMED:   with stride 500
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label opes.bias 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label funnelwall.bias 
PLUMED:    scalar with label upper_wall.bias 
PLUMED:    scalar with label ene 
PLUMED:    scalar with label cosang 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label L3 
PLUMED:    scalar with label L4 
PLUMED:    scalar with label V1 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:    scalar with label V3 
PLUMED:    scalar with label V4 
PLUMED:    scalar with label V5 
PLUMED:    scalar with label V6 
PLUMED:    scalar with label V7 
PLUMED:    scalar with label V8 
PLUMED:   on file COLVAR
PLUMED:   with format  %8.4f
PLUMED: END FILE: plumed.dat
PLUMED: Timestep: 1.000000
PLUMED: KbT: 2.490000
PLUMED: Relevant bibliography:
PLUMED:   [1] The PLUMED consortium, Nat. Methods 16, 670 (2019)
PLUMED:   [2] Tribello, Bonomi, Branduardi, Camilloni, and Bussi, Comput. Phys. Commun. 185, 604 (2014)
PLUMED:   [3] Bartels and Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 865 (1998)
PLUMED:   [4] Bonomi and Parrinello, J. Comp. Chem. 30, 1615 (2009)
PLUMED:   [5] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Phys. Chem. Lett. 11, 2731-2736 (2020)
PLUMED:   [6] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Chem. Theory Comput. 18, 3988-3996 (2022)
PLUMED: Please read and cite where appropriate!
PLUMED: Finished setup
PLUMED:                                               Cycles        Total      Average      Minimum      Maximum
PLUMED:                                                    1     0.042440     0.042440     0.042440     0.042440
