PLUMED: PLUMED is starting
PLUMED: Version: 2.10.0 (git: 09264719e) compiled on Jun 10 2026 at 10:34:57
PLUMED: Please cite these papers when using PLUMED [1][2]
PLUMED: For further information see the PLUMED web page at http://www.plumed.org
PLUMED: Root: /home/runner/opt/lib/plumed
PLUMED: LibraryPath: /home/runner/opt/lib/libplumedKernel.so
PLUMED: For installed feature, see /home/runner/opt/lib/plumed/src/config/config.txt
PLUMED: Molecular dynamics engine: driver
PLUMED: Precision of reals: 8
PLUMED: Running over 1 node
PLUMED: Number of threads: 1
PLUMED: Cache line size: 512
PLUMED: Number of atoms: 1000000
PLUMED: File suffix: 
PLUMED: FILE: plumed.dat
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label HOST
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57
PLUMED:  58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82
PLUMED:  83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107
PLUMED:  108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132
PLUMED:  133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157
PLUMED:  158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182
PLUMED:  183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207
PLUMED:  208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label LIGC
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l1
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  7
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l2
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  2
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l3
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  6
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l4
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  9
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label WO
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  229 232 235 238 241 244 247 250 253 256 259 262 265 268 271 274 277 280 283 286 289 292 295 298 301
PLUMED:  304 307 310 313 316 319 322 325 328 331 334 337 340 343 346 349 352 355 358 361 364 367 370 373 376
PLUMED:  379 382 385 388 391 394 397 400 403 406 409 412 415 418 421 424 427 430 433 436 439 442 445 448 451
PLUMED:  454 457 460 463 466 469 472 475 478 481 484 487 490 493 496 499 502 505 508 511 514 517 520 523 526
PLUMED:  529 532 535 538 541 544 547 550 553 556 559 562 565 568 571 574 577 580 583 586 589 592 595 598 601
PLUMED:  604 607 610 613 616 619 622 625 628 631 634 637 640 643 646 649 652 655 658 661 664 667 670 673 676
PLUMED:  679 682 685 688 691 694 697 700 703 706 709 712 715 718 721 724 727 730 733 736 739 742 745 748 751
PLUMED:  754 757 760 763 766 769 772 775 778 781 784 787 790 793 796 799 802 805 808 811 814 817 820 823 826
PLUMED:  829 832 835 838 841 844 847 850 853 856 859 862 865 868 871 874 877 880 883 886 889 892 895 898 901
PLUMED:  904 907 910 913 916 919 922 925 928 931 934 937 940 943 946 949 952 955 958 961 964 967 970 973 976
PLUMED:  979 982 985 988 991 994 997 1000 1003 1006 1009 1012 1015 1018 1021 1024 1027 1030 1033 1036 1039 1042 1045 1048 1051
PLUMED:  1054 1057 1060 1063 1066 1069 1072 1075 1078 1081 1084 1087 1090 1093 1096 1099 1102 1105 1108 1111 1114 1117 1120 1123 1126
PLUMED:  1129 1132 1135 1138 1141 1144 1147 1150 1153 1156 1159 1162 1165 1168 1171 1174 1177 1180 1183 1186 1189 1192 1195 1198 1201
PLUMED:  1204 1207 1210 1213 1216 1219 1222 1225 1228 1231 1234 1237 1240 1243 1246 1249 1252 1255 1258 1261 1264 1267 1270 1273 1276
PLUMED:  1279 1282 1285 1288 1291 1294 1297 1300 1303 1306 1309 1312 1315 1318 1321 1324 1327 1330 1333 1336 1339 1342 1345 1348 1351
PLUMED:  1354 1357 1360 1363 1366 1369 1372 1375 1378 1381 1384 1387 1390 1393 1396 1399 1402 1405 1408 1411 1414 1417 1420 1423 1426
PLUMED:  1429 1432 1435 1438 1441 1444 1447 1450 1453 1456 1459 1462 1465 1468 1471 1474 1477 1480 1483 1486 1489 1492 1495 1498 1501
PLUMED:  1504 1507 1510 1513 1516 1519 1522 1525 1528 1531 1534 1537 1540 1543 1546 1549 1552 1555 1558 1561 1564 1567 1570 1573 1576
PLUMED:  1579 1582 1585 1588 1591 1594 1597 1600 1603 1606 1609 1612 1615 1618 1621 1624 1627 1630 1633 1636 1639 1642 1645 1648 1651
PLUMED:  1654 1657 1660 1663 1666 1669 1672 1675 1678 1681 1684 1687 1690 1693 1696 1699 1702 1705 1708 1711 1714 1717 1720 1723 1726
PLUMED:  1729 1732 1735 1738 1741 1744 1747 1750 1753 1756 1759 1762 1765 1768 1771 1774 1777 1780 1783 1786 1789 1792 1795 1798 1801
PLUMED:  1804 1807 1810 1813 1816 1819 1822 1825 1828 1831 1834 1837 1840 1843 1846 1849 1852 1855 1858 1861 1864 1867 1870 1873 1876
PLUMED:  1879 1882 1885 1888 1891 1894 1897 1900 1903 1906 1909 1912 1915 1918 1921 1924 1927 1930 1933 1936 1939 1942 1945 1948 1951
PLUMED:  1954 1957 1960 1963 1966 1969 1972 1975 1978 1981 1984 1987 1990 1993 1996 1999 2002 2005 2008 2011 2014 2017 2020 2023 2026
PLUMED:  2029 2032 2035 2038 2041 2044 2047 2050 2053 2056 2059 2062 2065 2068 2071 2074 2077 2080 2083 2086 2089 2092 2095 2098 2101
PLUMED:  2104 2107 2110 2113 2116 2119 2122 2125 2128 2131 2134 2137 2140 2143 2146 2149 2152 2155 2158 2161 2164 2167 2170 2173 2176
PLUMED:  2179 2182 2185 2188 2191 2194 2197 2200 2203 2206 2209 2212 2215 2218 2221 2224 2227 2230 2233 2236 2239 2242 2245 2248 2251
PLUMED:  2254 2257 2260 2263 2266 2269 2272 2275 2278 2281 2284 2287 2290 2293 2296 2299 2302 2305 2308 2311 2314 2317 2320 2323 2326
PLUMED:  2329 2332 2335 2338 2341 2344 2347 2350 2353 2356 2359 2362 2365 2368 2371 2374 2377 2380 2383 2386 2389 2392 2395 2398 2401
PLUMED:  2404 2407 2410 2413 2416 2419 2422 2425 2428 2431 2434 2437 2440 2443 2446 2449 2452 2455 2458 2461 2464 2467 2470 2473 2476
PLUMED:  2479 2482 2485 2488 2491 2494 2497 2500 2503 2506 2509 2512 2515 2518 2521 2524 2527 2530 2533 2536 2539 2542 2545 2548 2551
PLUMED:  2554 2557 2560 2563 2566 2569 2572 2575 2578 2581 2584 2587 2590 2593 2596 2599 2602 2605 2608 2611 2614 2617 2620 2623 2626
PLUMED:  2629 2632 2635 2638 2641 2644 2647 2650 2653 2656 2659 2662 2665 2668 2671 2674 2677 2680 2683 2686 2689 2692 2695 2698 2701
PLUMED:  2704 2707 2710 2713 2716 2719 2722 2725 2728 2731 2734 2737 2740 2743 2746 2749 2752 2755 2758 2761 2764 2767 2770 2773 2776
PLUMED:  2779 2782 2785 2788 2791 2794 2797 2800 2803 2806 2809 2812 2815 2818 2821 2824 2827 2830 2833 2836 2839 2842 2845 2848 2851
PLUMED:  2854 2857 2860 2863 2866 2869 2872 2875 2878 2881 2884 2887 2890 2893 2896 2899 2902 2905 2908 2911 2914 2917 2920 2923 2926
PLUMED:  2929 2932 2935 2938 2941 2944 2947 2950 2953 2956 2959 2962 2965 2968 2971 2974 2977 2980 2983 2986 2989 2992 2995 2998 3001
PLUMED:  3004 3007 3010 3013 3016 3019 3022 3025 3028 3031 3034 3037 3040 3043 3046 3049 3052 3055 3058 3061 3064 3067 3070 3073 3076
PLUMED:  3079 3082 3085 3088 3091 3094 3097 3100 3103 3106 3109 3112 3115 3118 3121 3124 3127 3130 3133 3136 3139 3142 3145 3148 3151
PLUMED:  3154 3157 3160 3163 3166 3169 3172 3175 3178 3181 3184 3187 3190 3193 3196 3199 3202 3205 3208 3211 3214 3217 3220 3223 3226
PLUMED:  3229 3232 3235 3238 3241 3244 3247 3250 3253 3256 3259 3262 3265 3268 3271 3274 3277 3280 3283 3286 3289 3292 3295 3298 3301
PLUMED:  3304 3307 3310 3313 3316 3319 3322 3325 3328 3331 3334 3337 3340 3343 3346 3349 3352 3355 3358 3361 3364 3367 3370 3373 3376
PLUMED:  3379 3382 3385 3388 3391 3394 3397 3400 3403 3406 3409 3412 3415 3418 3421 3424 3427 3430 3433 3436 3439 3442 3445 3448 3451
PLUMED:  3454 3457 3460 3463 3466 3469 3472 3475 3478 3481 3484 3487 3490 3493 3496 3499 3502 3505 3508 3511 3514 3517 3520 3523 3526
PLUMED:  3529 3532 3535 3538 3541 3544 3547 3550 3553 3556 3559 3562 3565 3568 3571 3574 3577 3580 3583 3586 3589 3592 3595 3598 3601
PLUMED:  3604 3607 3610 3613 3616 3619 3622 3625 3628 3631 3634 3637 3640 3643 3646 3649 3652 3655 3658 3661 3664 3667 3670 3673 3676
PLUMED:  3679 3682 3685 3688 3691 3694 3697 3700 3703 3706 3709 3712 3715 3718 3721 3724 3727 3730 3733 3736 3739 3742 3745 3748 3751
PLUMED:  3754 3757 3760 3763 3766 3769 3772 3775 3778 3781 3784 3787 3790 3793 3796 3799 3802 3805 3808 3811 3814 3817 3820 3823 3826
PLUMED:  3829 3832 3835 3838 3841 3844 3847 3850 3853 3856 3859 3862 3865 3868 3871 3874 3877 3880 3883 3886 3889 3892 3895 3898 3901
PLUMED:  3904 3907 3910 3913 3916 3919 3922 3925 3928 3931 3934 3937 3940 3943 3946 3949 3952 3955 3958 3961 3964 3967 3970 3973 3976
PLUMED:  3979 3982 3985 3988 3991 3994 3997 4000 4003 4006 4009 4012 4015 4018 4021 4024 4027 4030 4033 4036 4039 4042 4045 4048 4051
PLUMED:  4054 4057 4060 4063 4066 4069 4072 4075 4078 4081 4084 4087 4090 4093 4096 4099 4102 4105 4108 4111 4114 4117 4120 4123 4126
PLUMED:  4129 4132 4135 4138 4141 4144 4147 4150 4153 4156 4159 4162 4165 4168 4171 4174 4177 4180 4183 4186 4189 4192 4195 4198 4201
PLUMED:  4204 4207 4210 4213 4216 4219 4222 4225 4228 4231 4234 4237 4240 4243 4246 4249 4252 4255 4258 4261 4264 4267 4270 4273 4276
PLUMED:  4279 4282 4285 4288 4291 4294 4297 4300 4303 4306 4309 4312 4315 4318 4321 4324 4327 4330 4333 4336 4339 4342 4345 4348 4351
PLUMED:  4354 4357 4360 4363 4366 4369 4372 4375 4378 4381 4384 4387 4390 4393 4396 4399 4402 4405 4408 4411 4414 4417 4420 4423 4426
PLUMED:  4429 4432 4435 4438 4441 4444 4447 4450 4453 4456 4459 4462 4465 4468 4471 4474 4477 4480 4483 4486 4489 4492 4495 4498 4501
PLUMED:  4504 4507 4510 4513 4516 4519 4522 4525 4528 4531 4534 4537 4540 4543 4546 4549 4552 4555 4558 4561 4564 4567 4570 4573 4576
PLUMED:  4579 4582 4585 4588 4591 4594 4597 4600 4603 4606 4609 4612 4615 4618 4621 4624 4627 4630 4633 4636 4639 4642 4645 4648 4651
PLUMED:  4654 4657 4660 4663 4666 4669 4672 4675 4678 4681 4684 4687 4690 4693 4696 4699 4702 4705 4708 4711 4714 4717 4720 4723 4726
PLUMED:  4729 4732 4735 4738 4741 4744 4747 4750 4753 4756 4759 4762 4765 4768 4771 4774 4777 4780 4783 4786 4789 4792 4795 4798 4801
PLUMED:  4804 4807 4810 4813 4816 4819 4822 4825 4828 4831 4834 4837 4840 4843 4846 4849 4852 4855 4858 4861 4864 4867 4870 4873 4876
PLUMED:  4879 4882 4885 4888 4891 4894 4897 4900 4903 4906 4909 4912 4915 4918 4921 4924 4927 4930 4933 4936 4939 4942 4945 4948 4951
PLUMED:  4954 4957 4960 4963 4966 4969 4972 4975 4978 4981 4984 4987 4990 4993 4996 4999 5002 5005 5008 5011 5014 5017 5020 5023 5026
PLUMED:  5029 5032 5035 5038 5041 5044 5047 5050 5053 5056 5059 5062 5065 5068 5071 5074 5077 5080 5083 5086 5089 5092 5095 5098 5101
PLUMED:  5104 5107 5110 5113 5116 5119 5122 5125 5128 5131 5134 5137 5140 5143 5146 5149 5152 5155 5158 5161 5164 5167 5170 5173 5176
PLUMED:  5179 5182 5185 5188 5191 5194 5197 5200 5203 5206 5209 5212 5215 5218 5221 5224 5227 5230 5233 5236 5239 5242 5245 5248 5251
PLUMED:  5254 5257 5260 5263 5266 5269 5272 5275 5278 5281 5284 5287 5290 5293 5296 5299 5302 5305 5308 5311 5314 5317 5320 5323 5326
PLUMED:  5329 5332 5335 5338 5341 5344 5347 5350 5353 5356 5359 5362 5365 5368 5371 5374 5377 5380 5383 5386 5389 5392 5395 5398 5401
PLUMED:  5404 5407 5410 5413 5416 5419 5422 5425 5428 5431 5434 5437 5440 5443 5446 5449 5452 5455 5458 5461 5464 5467 5470 5473 5476
PLUMED:  5479 5482 5485 5488 5491 5494 5497 5500 5503 5506 5509 5512 5515 5518 5521 5524 5527 5530 5533 5536 5539 5542 5545 5548 5551
PLUMED:  5554 5557 5560 5563 5566 5569 5572 5575 5578 5581 5584 5587 5590 5593 5596 5599 5602 5605 5608 5611 5614 5617 5620 5623 5626
PLUMED:  5629 5632 5635 5638 5641 5644 5647 5650 5653 5656 5659 5662 5665 5668 5671 5674 5677 5680 5683 5686 5689 5692 5695 5698 5701
PLUMED:  5704 5707 5710 5713 5716 5719 5722 5725 5728 5731 5734 5737 5740 5743 5746 5749 5752 5755 5758 5761 5764 5767 5770 5773 5776
PLUMED:  5779 5782 5785 5788 5791 5794 5797 5800 5803 5806 5809 5812 5815 5818 5821 5824 5827 5830 5833 5836 5839 5842 5845 5848 5851
PLUMED:  5854 5857 5860 5863 5866 5869 5872 5875 5878 5881 5884 5887 5890 5893 5896 5899 5902 5905 5908 5911 5914 5917 5920 5923 5926
PLUMED:  5929 5932 5935 5938 5941 5944 5947 5950 5953 5956 5959 5962 5965 5968 5971 5974 5977 5980 5983 5986 5989 5992 5995 5998 6001
PLUMED:  6004 6007 6010 6013 6016 6019 6022 6025 6028 6031 6034 6037 6040 6043 6046 6049 6052 6055 6058 6061 6064 6067 6070 6073 6076
PLUMED:  6079 6082 6085 6088 6091 6094 6097 6100 6103 6106 6109 6112 6115 6118 6121 6124 6127 6130 6133 6136 6139 6142 6145 6148 6151
PLUMED:  6154 6157 6160 6163 6166 6169 6172 6175 6178 6181 6184 6187 6190 6193 6196 6199 6202 6205 6208 6211 6214 6217 6220 6223 6226
PLUMED:  6229 6232 6235 6238 6241 6244 6247 6250 6253 6256 6259 6262 6265 6268 6271 6274 6277 6280 6283 6286 6289 6292 6295 6298 6301
PLUMED:  6304 6307 6310 6313 6316 6319 6322 6325 6328 6331 6334 6337 6340 6343 6346 6349 6352 6355 6358 6361 6364 6367 6370 6373 6376
PLUMED:  6379 6382 6385 6388 6391 6394 6397 6400 6403 6406 6409 6412 6415 6418 6421 6424 6427 6430 6433 6436 6439 6442 6445 6448 6451
PLUMED:  6454 6457 6460 6463 6466 6469 6472 6475 6478 6481 6484 6487 6490 6493 6496 6499 6502 6505 6508 6511 6514 6517 6520 6523 6526
PLUMED:  6529 6532 6535 6538 6541 6544 6547 6550 6553 6556 6559 6562 6565 6568 6571 6574 6577 6580 6583 6586 6589 6592 6595 6598 6601
PLUMED:  6604 6607 6610 6613 6616 6619 6622 6625 6628 6631 6634 6637 6640 6643 6646 6649 6652 6655 6658 6661 6664 6667 6670 6673 6676
PLUMED:  6679 6682 6685 6688 6691 6694 6697 6700 6703 6706 6709 6712 6715 6718 6721 6724 6727 6730 6733 6736 6739 6742 6745 6748 6751
PLUMED:  6754 6757 6760 6763 6766 6769 6772 6775 6778 6781 6784 6787 6790 6793 6796 6799 6802 6805 6808 6811 6814 6817 6820 6823 6826
PLUMED:  6829 6832 6835 6838 6841
PLUMED: Action WHOLEMOLECULES
PLUMED:   with label @7
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   atoms in entity 0 : 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 
PLUMED: Action FIT_TO_TEMPLATE
PLUMED:   with label @8
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   found 40 atoms in input 
PLUMED:   with indices : 
PLUMED: 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 
PLUMED: 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 
PLUMED:   Method chosen for fitting: OPTIMAL 
PLUMED: WARNING for action FIT_TO_TEMPLATE with label @8 : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED: Action CENTER
PLUMED:   with label lig
PLUMED: Action CENTER_FAST
PLUMED:   with label lig
PLUMED:   added component to this action:  lig.x 
PLUMED:   added component to this action:  lig.y 
PLUMED:   added component to this action:  lig.z 
PLUMED:   added component to this action:  lig.mass 
PLUMED:   added component to this action:  lig.charge 
PLUMED:   of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
PLUMED:  using the geometric center
PLUMED:   broken molecules will be rebuilt assuming atoms are in the proper order
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v1
PLUMED:   added component to this action:  v1.x 
PLUMED:   added component to this action:  v1.y 
PLUMED:   added component to this action:  v1.z 
PLUMED:   added component to this action:  v1.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v1.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v2
PLUMED:   added component to this action:  v2.x 
PLUMED:   added component to this action:  v2.y 
PLUMED:   added component to this action:  v2.z 
PLUMED:   added component to this action:  v2.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v2.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v3
PLUMED:   added component to this action:  v3.x 
PLUMED:   added component to this action:  v3.y 
PLUMED:   added component to this action:  v3.z 
PLUMED:   added component to this action:  v3.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v3.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v4
PLUMED:   added component to this action:  v4.x 
PLUMED:   added component to this action:  v4.y 
PLUMED:   added component to this action:  v4.z 
PLUMED:   added component to this action:  v4.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v4.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.75
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v5
PLUMED:   added component to this action:  v5.x 
PLUMED:   added component to this action:  v5.y 
PLUMED:   added component to this action:  v5.z 
PLUMED:   added component to this action:  v5.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v5.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v6
PLUMED:   added component to this action:  v6.x 
PLUMED:   added component to this action:  v6.y 
PLUMED:   added component to this action:  v6.z 
PLUMED:   added component to this action:  v6.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v6.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v7
PLUMED:   added component to this action:  v7.x 
PLUMED:   added component to this action:  v7.y 
PLUMED:   added component to this action:  v7.z 
PLUMED:   added component to this action:  v7.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v7.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v8
PLUMED:   added component to this action:  v8.x 
PLUMED:   added component to this action:  v8.y 
PLUMED:   added component to this action:  v8.z 
PLUMED:   added component to this action:  v8.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v8.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.75
PLUMED: Action DISTANCE
PLUMED:   with label cyl
PLUMED:   between atoms 1000002 1000001
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   added component to this action:  cyl.x 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.y 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.z 
PLUMED:   WARNING: components will not have the proper periodicity - see manual
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label radius
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.x 
PLUMED:    scalar with label cyl.y 
PLUMED:   with function : sqrt(x*x+y*y)
PLUMED:   with variables : x y
PLUMED:   function as parsed by lepton: sqrt((square(x))+(square(y)))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((x)+(x))
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((y)+(y))
PLUMED:   not calculating when all arguments are zero 
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   7  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   2  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000003  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   6  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   9  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000002  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000004  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000005  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V5
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000006  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V6
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000007  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V7
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000008  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V8
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000009  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   229  232  235  238  241  244  247  250  253  256  259  262  265  268  271  274  277  280  283  286  289  292  295  298  
PLUMED:   301  304  307  310  313  316  319  322  325  328  331  334  337  340  343  346  349  352  355  358  361  364  367  370  373  
PLUMED:   376  379  382  385  388  391  394  397  400  403  406  409  412  415  418  421  424  427  430  433  436  439  442  445  448  
PLUMED:   451  454  457  460  463  466  469  472  475  478  481  484  487  490  493  496  499  502  505  508  511  514  517  520  523  
PLUMED:   526  529  532  535  538  541  544  547  550  553  556  559  562  565  568  571  574  577  580  583  586  589  592  595  598  
PLUMED:   601  604  607  610  613  616  619  622  625  628  631  634  637  640  643  646  649  652  655  658  661  664  667  670  673  
PLUMED:   676  679  682  685  688  691  694  697  700  703  706  709  712  715  718  721  724  727  730  733  736  739  742  745  748  
PLUMED:   751  754  757  760  763  766  769  772  775  778  781  784  787  790  793  796  799  802  805  808  811  814  817  820  823  
PLUMED:   826  829  832  835  838  841  844  847  850  853  856  859  862  865  868  871  874  877  880  883  886  889  892  895  898  
PLUMED:   901  904  907  910  913  916  919  922  925  928  931  934  937  940  943  946  949  952  955  958  961  964  967  970  973  
PLUMED:   976  979  982  985  988  991  994  997  1000  1003  1006  1009  1012  1015  1018  1021  1024  1027  1030  1033  1036  1039  1042  1045  1048  
PLUMED:   1051  1054  1057  1060  1063  1066  1069  1072  1075  1078  1081  1084  1087  1090  1093  1096  1099  1102  1105  1108  1111  1114  1117  1120  1123  
PLUMED:   1126  1129  1132  1135  1138  1141  1144  1147  1150  1153  1156  1159  1162  1165  1168  1171  1174  1177  1180  1183  1186  1189  1192  1195  1198  
PLUMED:   1201  1204  1207  1210  1213  1216  1219  1222  1225  1228  1231  1234  1237  1240  1243  1246  1249  1252  1255  1258  1261  1264  1267  1270  1273  
PLUMED:   1276  1279  1282  1285  1288  1291  1294  1297  1300  1303  1306  1309  1312  1315  1318  1321  1324  1327  1330  1333  1336  1339  1342  1345  1348  
PLUMED:   1351  1354  1357  1360  1363  1366  1369  1372  1375  1378  1381  1384  1387  1390  1393  1396  1399  1402  1405  1408  1411  1414  1417  1420  1423  
PLUMED:   1426  1429  1432  1435  1438  1441  1444  1447  1450  1453  1456  1459  1462  1465  1468  1471  1474  1477  1480  1483  1486  1489  1492  1495  1498  
PLUMED:   1501  1504  1507  1510  1513  1516  1519  1522  1525  1528  1531  1534  1537  1540  1543  1546  1549  1552  1555  1558  1561  1564  1567  1570  1573  
PLUMED:   1576  1579  1582  1585  1588  1591  1594  1597  1600  1603  1606  1609  1612  1615  1618  1621  1624  1627  1630  1633  1636  1639  1642  1645  1648  
PLUMED:   1651  1654  1657  1660  1663  1666  1669  1672  1675  1678  1681  1684  1687  1690  1693  1696  1699  1702  1705  1708  1711  1714  1717  1720  1723  
PLUMED:   1726  1729  1732  1735  1738  1741  1744  1747  1750  1753  1756  1759  1762  1765  1768  1771  1774  1777  1780  1783  1786  1789  1792  1795  1798  
PLUMED:   1801  1804  1807  1810  1813  1816  1819  1822  1825  1828  1831  1834  1837  1840  1843  1846  1849  1852  1855  1858  1861  1864  1867  1870  1873  
PLUMED:   1876  1879  1882  1885  1888  1891  1894  1897  1900  1903  1906  1909  1912  1915  1918  1921  1924  1927  1930  1933  1936  1939  1942  1945  1948  
PLUMED:   1951  1954  1957  1960  1963  1966  1969  1972  1975  1978  1981  1984  1987  1990  1993  1996  1999  2002  2005  2008  2011  2014  2017  2020  2023  
PLUMED:   2026  2029  2032  2035  2038  2041  2044  2047  2050  2053  2056  2059  2062  2065  2068  2071  2074  2077  2080  2083  2086  2089  2092  2095  2098  
PLUMED:   2101  2104  2107  2110  2113  2116  2119  2122  2125  2128  2131  2134  2137  2140  2143  2146  2149  2152  2155  2158  2161  2164  2167  2170  2173  
PLUMED:   2176  2179  2182  2185  2188  2191  2194  2197  2200  2203  2206  2209  2212  2215  2218  2221  2224  2227  2230  2233  2236  2239  2242  2245  2248  
PLUMED:   2251  2254  2257  2260  2263  2266  2269  2272  2275  2278  2281  2284  2287  2290  2293  2296  2299  2302  2305  2308  2311  2314  2317  2320  2323  
PLUMED:   2326  2329  2332  2335  2338  2341  2344  2347  2350  2353  2356  2359  2362  2365  2368  2371  2374  2377  2380  2383  2386  2389  2392  2395  2398  
PLUMED:   2401  2404  2407  2410  2413  2416  2419  2422  2425  2428  2431  2434  2437  2440  2443  2446  2449  2452  2455  2458  2461  2464  2467  2470  2473  
PLUMED:   2476  2479  2482  2485  2488  2491  2494  2497  2500  2503  2506  2509  2512  2515  2518  2521  2524  2527  2530  2533  2536  2539  2542  2545  2548  
PLUMED:   2551  2554  2557  2560  2563  2566  2569  2572  2575  2578  2581  2584  2587  2590  2593  2596  2599  2602  2605  2608  2611  2614  2617  2620  2623  
PLUMED:   2626  2629  2632  2635  2638  2641  2644  2647  2650  2653  2656  2659  2662  2665  2668  2671  2674  2677  2680  2683  2686  2689  2692  2695  2698  
PLUMED:   2701  2704  2707  2710  2713  2716  2719  2722  2725  2728  2731  2734  2737  2740  2743  2746  2749  2752  2755  2758  2761  2764  2767  2770  2773  
PLUMED:   2776  2779  2782  2785  2788  2791  2794  2797  2800  2803  2806  2809  2812  2815  2818  2821  2824  2827  2830  2833  2836  2839  2842  2845  2848  
PLUMED:   2851  2854  2857  2860  2863  2866  2869  2872  2875  2878  2881  2884  2887  2890  2893  2896  2899  2902  2905  2908  2911  2914  2917  2920  2923  
PLUMED:   2926  2929  2932  2935  2938  2941  2944  2947  2950  2953  2956  2959  2962  2965  2968  2971  2974  2977  2980  2983  2986  2989  2992  2995  2998  
PLUMED:   3001  3004  3007  3010  3013  3016  3019  3022  3025  3028  3031  3034  3037  3040  3043  3046  3049  3052  3055  3058  3061  3064  3067  3070  3073  
PLUMED:   3076  3079  3082  3085  3088  3091  3094  3097  3100  3103  3106  3109  3112  3115  3118  3121  3124  3127  3130  3133  3136  3139  3142  3145  3148  
PLUMED:   3151  3154  3157  3160  3163  3166  3169  3172  3175  3178  3181  3184  3187  3190  3193  3196  3199  3202  3205  3208  3211  3214  3217  3220  3223  
PLUMED:   3226  3229  3232  3235  3238  3241  3244  3247  3250  3253  3256  3259  3262  3265  3268  3271  3274  3277  3280  3283  3286  3289  3292  3295  3298  
PLUMED:   3301  3304  3307  3310  3313  3316  3319  3322  3325  3328  3331  3334  3337  3340  3343  3346  3349  3352  3355  3358  3361  3364  3367  3370  3373  
PLUMED:   3376  3379  3382  3385  3388  3391  3394  3397  3400  3403  3406  3409  3412  3415  3418  3421  3424  3427  3430  3433  3436  3439  3442  3445  3448  
PLUMED:   3451  3454  3457  3460  3463  3466  3469  3472  3475  3478  3481  3484  3487  3490  3493  3496  3499  3502  3505  3508  3511  3514  3517  3520  3523  
PLUMED:   3526  3529  3532  3535  3538  3541  3544  3547  3550  3553  3556  3559  3562  3565  3568  3571  3574  3577  3580  3583  3586  3589  3592  3595  3598  
PLUMED:   3601  3604  3607  3610  3613  3616  3619  3622  3625  3628  3631  3634  3637  3640  3643  3646  3649  3652  3655  3658  3661  3664  3667  3670  3673  
PLUMED:   3676  3679  3682  3685  3688  3691  3694  3697  3700  3703  3706  3709  3712  3715  3718  3721  3724  3727  3730  3733  3736  3739  3742  3745  3748  
PLUMED:   3751  3754  3757  3760  3763  3766  3769  3772  3775  3778  3781  3784  3787  3790  3793  3796  3799  3802  3805  3808  3811  3814  3817  3820  3823  
PLUMED:   3826  3829  3832  3835  3838  3841  3844  3847  3850  3853  3856  3859  3862  3865  3868  3871  3874  3877  3880  3883  3886  3889  3892  3895  3898  
PLUMED:   3901  3904  3907  3910  3913  3916  3919  3922  3925  3928  3931  3934  3937  3940  3943  3946  3949  3952  3955  3958  3961  3964  3967  3970  3973  
PLUMED:   3976  3979  3982  3985  3988  3991  3994  3997  4000  4003  4006  4009  4012  4015  4018  4021  4024  4027  4030  4033  4036  4039  4042  4045  4048  
PLUMED:   4051  4054  4057  4060  4063  4066  4069  4072  4075  4078  4081  4084  4087  4090  4093  4096  4099  4102  4105  4108  4111  4114  4117  4120  4123  
PLUMED:   4126  4129  4132  4135  4138  4141  4144  4147  4150  4153  4156  4159  4162  4165  4168  4171  4174  4177  4180  4183  4186  4189  4192  4195  4198  
PLUMED:   4201  4204  4207  4210  4213  4216  4219  4222  4225  4228  4231  4234  4237  4240  4243  4246  4249  4252  4255  4258  4261  4264  4267  4270  4273  
PLUMED:   4276  4279  4282  4285  4288  4291  4294  4297  4300  4303  4306  4309  4312  4315  4318  4321  4324  4327  4330  4333  4336  4339  4342  4345  4348  
PLUMED:   4351  4354  4357  4360  4363  4366  4369  4372  4375  4378  4381  4384  4387  4390  4393  4396  4399  4402  4405  4408  4411  4414  4417  4420  4423  
PLUMED:   4426  4429  4432  4435  4438  4441  4444  4447  4450  4453  4456  4459  4462  4465  4468  4471  4474  4477  4480  4483  4486  4489  4492  4495  4498  
PLUMED:   4501  4504  4507  4510  4513  4516  4519  4522  4525  4528  4531  4534  4537  4540  4543  4546  4549  4552  4555  4558  4561  4564  4567  4570  4573  
PLUMED:   4576  4579  4582  4585  4588  4591  4594  4597  4600  4603  4606  4609  4612  4615  4618  4621  4624  4627  4630  4633  4636  4639  4642  4645  4648  
PLUMED:   4651  4654  4657  4660  4663  4666  4669  4672  4675  4678  4681  4684  4687  4690  4693  4696  4699  4702  4705  4708  4711  4714  4717  4720  4723  
PLUMED:   4726  4729  4732  4735  4738  4741  4744  4747  4750  4753  4756  4759  4762  4765  4768  4771  4774  4777  4780  4783  4786  4789  4792  4795  4798  
PLUMED:   4801  4804  4807  4810  4813  4816  4819  4822  4825  4828  4831  4834  4837  4840  4843  4846  4849  4852  4855  4858  4861  4864  4867  4870  4873  
PLUMED:   4876  4879  4882  4885  4888  4891  4894  4897  4900  4903  4906  4909  4912  4915  4918  4921  4924  4927  4930  4933  4936  4939  4942  4945  4948  
PLUMED:   4951  4954  4957  4960  4963  4966  4969  4972  4975  4978  4981  4984  4987  4990  4993  4996  4999  5002  5005  5008  5011  5014  5017  5020  5023  
PLUMED:   5026  5029  5032  5035  5038  5041  5044  5047  5050  5053  5056  5059  5062  5065  5068  5071  5074  5077  5080  5083  5086  5089  5092  5095  5098  
PLUMED:   5101  5104  5107  5110  5113  5116  5119  5122  5125  5128  5131  5134  5137  5140  5143  5146  5149  5152  5155  5158  5161  5164  5167  5170  5173  
PLUMED:   5176  5179  5182  5185  5188  5191  5194  5197  5200  5203  5206  5209  5212  5215  5218  5221  5224  5227  5230  5233  5236  5239  5242  5245  5248  
PLUMED:   5251  5254  5257  5260  5263  5266  5269  5272  5275  5278  5281  5284  5287  5290  5293  5296  5299  5302  5305  5308  5311  5314  5317  5320  5323  
PLUMED:   5326  5329  5332  5335  5338  5341  5344  5347  5350  5353  5356  5359  5362  5365  5368  5371  5374  5377  5380  5383  5386  5389  5392  5395  5398  
PLUMED:   5401  5404  5407  5410  5413  5416  5419  5422  5425  5428  5431  5434  5437  5440  5443  5446  5449  5452  5455  5458  5461  5464  5467  5470  5473  
PLUMED:   5476  5479  5482  5485  5488  5491  5494  5497  5500  5503  5506  5509  5512  5515  5518  5521  5524  5527  5530  5533  5536  5539  5542  5545  5548  
PLUMED:   5551  5554  5557  5560  5563  5566  5569  5572  5575  5578  5581  5584  5587  5590  5593  5596  5599  5602  5605  5608  5611  5614  5617  5620  5623  
PLUMED:   5626  5629  5632  5635  5638  5641  5644  5647  5650  5653  5656  5659  5662  5665  5668  5671  5674  5677  5680  5683  5686  5689  5692  5695  5698  
PLUMED:   5701  5704  5707  5710  5713  5716  5719  5722  5725  5728  5731  5734  5737  5740  5743  5746  5749  5752  5755  5758  5761  5764  5767  5770  5773  
PLUMED:   5776  5779  5782  5785  5788  5791  5794  5797  5800  5803  5806  5809  5812  5815  5818  5821  5824  5827  5830  5833  5836  5839  5842  5845  5848  
PLUMED:   5851  5854  5857  5860  5863  5866  5869  5872  5875  5878  5881  5884  5887  5890  5893  5896  5899  5902  5905  5908  5911  5914  5917  5920  5923  
PLUMED:   5926  5929  5932  5935  5938  5941  5944  5947  5950  5953  5956  5959  5962  5965  5968  5971  5974  5977  5980  5983  5986  5989  5992  5995  5998  
PLUMED:   6001  6004  6007  6010  6013  6016  6019  6022  6025  6028  6031  6034  6037  6040  6043  6046  6049  6052  6055  6058  6061  6064  6067  6070  6073  
PLUMED:   6076  6079  6082  6085  6088  6091  6094  6097  6100  6103  6106  6109  6112  6115  6118  6121  6124  6127  6130  6133  6136  6139  6142  6145  6148  
PLUMED:   6151  6154  6157  6160  6163  6166  6169  6172  6175  6178  6181  6184  6187  6190  6193  6196  6199  6202  6205  6208  6211  6214  6217  6220  6223  
PLUMED:   6226  6229  6232  6235  6238  6241  6244  6247  6250  6253  6256  6259  6262  6265  6268  6271  6274  6277  6280  6283  6286  6289  6292  6295  6298  
PLUMED:   6301  6304  6307  6310  6313  6316  6319  6322  6325  6328  6331  6334  6337  6340  6343  6346  6349  6352  6355  6358  6361  6364  6367  6370  6373  
PLUMED:   6376  6379  6382  6385  6388  6391  6394  6397  6400  6403  6406  6409  6412  6415  6418  6421  6424  6427  6430  6433  6436  6439  6442  6445  6448  
PLUMED:   6451  6454  6457  6460  6463  6466  6469  6472  6475  6478  6481  6484  6487  6490  6493  6496  6499  6502  6505  6508  6511  6514  6517  6520  6523  
PLUMED:   6526  6529  6532  6535  6538  6541  6544  6547  6550  6553  6556  6559  6562  6565  6568  6571  6574  6577  6580  6583  6586  6589  6592  6595  6598  
PLUMED:   6601  6604  6607  6610  6613  6616  6619  6622  6625  6628  6631  6634  6637  6640  6643  6646  6649  6652  6655  6658  6661  6664  6667  6670  6673  
PLUMED:   6676  6679  6682  6685  6688  6691  6694  6697  6700  6703  6706  6709  6712  6715  6718  6721  6724  6727  6730  6733  6736  6739  6742  6745  6748  
PLUMED:   6751  6754  6757  6760  6763  6766  6769  6772  6775  6778  6781  6784  6787  6790  6793  6796  6799  6802  6805  6808  6811  6814  6817  6820  6823  
PLUMED:   6826  6829  6832  6835  6838  6841  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action ANGLE
PLUMED:   with label ang
PLUMED:   between lines 1000004-1000006 and 1-9
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label cosang
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label ang 
PLUMED:   with function : cos(x)
PLUMED:   with variables : x
PLUMED:   function as parsed by lepton: cos(x)
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     -(sin(x))
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label funnel
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   with function : (r+1.0*(-1.2+z))*step(-z+1.)+(r-0.2)*step(z-1.)
PLUMED:   with variables : r z
PLUMED:   function as parsed by lepton: (((r)+(-1.2+(z)))*(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(step(-1+(z))))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+(((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))+(step(-1+(z))))
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label funnelwall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label funnel 
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.bias 
PLUMED:   at 0.000000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 2000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.force2 
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label upper_wall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.bias 
PLUMED:   at 1.800000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 4000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.force2 
PLUMED: Action ENERGY
PLUMED:   with label ene
PLUMED: WARNING for action ENERGY with label ene : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED:   Bibliography [3][4]
PLUMED: Action OPES_METAD_EXPLORE
PLUMED:   with label opes
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:   added component to this action:  opes.bias 
PLUMED:  +++ WARNING +++ the provided STATE_RFILE will be ignored, since RESTART was not requested
PLUMED:   added component to this action:  opes.rct 
PLUMED:   added component to this action:  opes.zed 
PLUMED:   added component to this action:  opes.neff 
PLUMED:   added component to this action:  opes.nker 
PLUMED:   temperature = 299.478
PLUMED:   beta = 0.401606
PLUMED:   depositing new kernels with PACE = 10000
PLUMED:   expected BARRIER is 50
PLUMED:   using target distribution with BIASFACTOR gamma = 20.0803
PLUMED:   adaptive SIGMA will be used, with ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE = 100000
PLUMED:     thus the first x kernel depositions will be skipped, x = ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE/PACE = 10
PLUMED:   kernels are truncated with KERNELS_CUTOFF = 6.33724
PLUMED:   the value at cutoff is = 1.90207e-09
PLUMED:   regularization EPSILON = 0.349095
PLUMED:   kernels will be compressed when closer than COMPRESSION_THRESHOLD = 1
PLUMED:   state checkpoints are written on file compressed.Kernels.data only on CPT events (or never if MD code does define them!)
PLUMED:   Bibliography: [5][6]
PLUMED: Action PRINT
PLUMED:   with label @46
PLUMED:   with stride 500
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label opes.bias 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label funnelwall.bias 
PLUMED:    scalar with label upper_wall.bias 
PLUMED:    scalar with label ene 
PLUMED:    scalar with label cosang 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label L3 
PLUMED:    scalar with label L4 
PLUMED:    scalar with label V1 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:    scalar with label V3 
PLUMED:    scalar with label V4 
PLUMED:    scalar with label V5 
PLUMED:    scalar with label V6 
PLUMED:    scalar with label V7 
PLUMED:    scalar with label V8 
PLUMED:   on file COLVAR
PLUMED:   with format  %8.4f
PLUMED: END FILE: plumed.dat
PLUMED: Timestep: 1.000000
PLUMED: KbT: 2.490000
PLUMED: Relevant bibliography:
PLUMED:   [1] The PLUMED consortium, Nat. Methods 16, 670 (2019)
PLUMED:   [2] Tribello, Bonomi, Branduardi, Camilloni, and Bussi, Comput. Phys. Commun. 185, 604 (2014)
PLUMED:   [3] Bartels and Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 865 (1998)
PLUMED:   [4] Bonomi and Parrinello, J. Comp. Chem. 30, 1615 (2009)
PLUMED:   [5] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Phys. Chem. Lett. 11, 2731-2736 (2020)
PLUMED:   [6] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Chem. Theory Comput. 18, 3988-3996 (2022)
PLUMED: Please read and cite where appropriate!
PLUMED: Finished setup
PLUMED:                                               Cycles        Total      Average      Minimum      Maximum
PLUMED:                                                    1     0.043129     0.043129     0.043129     0.043129
