PLUMED: PLUMED is starting
PLUMED: Version: 2.10.0 (git: 09264719e) compiled on Jun 10 2026 at 10:34:57
PLUMED: Please cite these papers when using PLUMED [1][2]
PLUMED: For further information see the PLUMED web page at http://www.plumed.org
PLUMED: Root: /home/runner/opt/lib/plumed
PLUMED: LibraryPath: /home/runner/opt/lib/libplumedKernel.so
PLUMED: For installed feature, see /home/runner/opt/lib/plumed/src/config/config.txt
PLUMED: Molecular dynamics engine: driver
PLUMED: Precision of reals: 8
PLUMED: Running over 1 node
PLUMED: Number of threads: 1
PLUMED: Cache line size: 512
PLUMED: Number of atoms: 1000000
PLUMED: File suffix: 
PLUMED: FILE: plumed.dat
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label HOST
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
PLUMED:  41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65
PLUMED:  66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90
PLUMED:  91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115
PLUMED:  116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140
PLUMED:  141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165
PLUMED:  166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190
PLUMED:  191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label LIGC
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l1
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  9
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l2
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  3
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l3
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  1
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label l4
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  10
PLUMED: Action GROUP
PLUMED:   with label WO
PLUMED:   list of atoms:
PLUMED:  212 215 218 221 224 227 230 233 236 239 242 245 248 251 254 257 260 263 266 269 272 275 278 281 284
PLUMED:  287 290 293 296 299 302 305 308 311 314 317 320 323 326 329 332 335 338 341 344 347 350 353 356 359
PLUMED:  362 365 368 371 374 377 380 383 386 389 392 395 398 401 404 407 410 413 416 419 422 425 428 431 434
PLUMED:  437 440 443 446 449 452 455 458 461 464 467 470 473 476 479 482 485 488 491 494 497 500 503 506 509
PLUMED:  512 515 518 521 524 527 530 533 536 539 542 545 548 551 554 557 560 563 566 569 572 575 578 581 584
PLUMED:  587 590 593 596 599 602 605 608 611 614 617 620 623 626 629 632 635 638 641 644 647 650 653 656 659
PLUMED:  662 665 668 671 674 677 680 683 686 689 692 695 698 701 704 707 710 713 716 719 722 725 728 731 734
PLUMED:  737 740 743 746 749 752 755 758 761 764 767 770 773 776 779 782 785 788 791 794 797 800 803 806 809
PLUMED:  812 815 818 821 824 827 830 833 836 839 842 845 848 851 854 857 860 863 866 869 872 875 878 881 884
PLUMED:  887 890 893 896 899 902 905 908 911 914 917 920 923 926 929 932 935 938 941 944 947 950 953 956 959
PLUMED:  962 965 968 971 974 977 980 983 986 989 992 995 998 1001 1004 1007 1010 1013 1016 1019 1022 1025 1028 1031 1034
PLUMED:  1037 1040 1043 1046 1049 1052 1055 1058 1061 1064 1067 1070 1073 1076 1079 1082 1085 1088 1091 1094 1097 1100 1103 1106 1109
PLUMED:  1112 1115 1118 1121 1124 1127 1130 1133 1136 1139 1142 1145 1148 1151 1154 1157 1160 1163 1166 1169 1172 1175 1178 1181 1184
PLUMED:  1187 1190 1193 1196 1199 1202 1205 1208 1211 1214 1217 1220 1223 1226 1229 1232 1235 1238 1241 1244 1247 1250 1253 1256 1259
PLUMED:  1262 1265 1268 1271 1274 1277 1280 1283 1286 1289 1292 1295 1298 1301 1304 1307 1310 1313 1316 1319 1322 1325 1328 1331 1334
PLUMED:  1337 1340 1343 1346 1349 1352 1355 1358 1361 1364 1367 1370 1373 1376 1379 1382 1385 1388 1391 1394 1397 1400 1403 1406 1409
PLUMED:  1412 1415 1418 1421 1424 1427 1430 1433 1436 1439 1442 1445 1448 1451 1454 1457 1460 1463 1466 1469 1472 1475 1478 1481 1484
PLUMED:  1487 1490 1493 1496 1499 1502 1505 1508 1511 1514 1517 1520 1523 1526 1529 1532 1535 1538 1541 1544 1547 1550 1553 1556 1559
PLUMED:  1562 1565 1568 1571 1574 1577 1580 1583 1586 1589 1592 1595 1598 1601 1604 1607 1610 1613 1616 1619 1622 1625 1628 1631 1634
PLUMED:  1637 1640 1643 1646 1649 1652 1655 1658 1661 1664 1667 1670 1673 1676 1679 1682 1685 1688 1691 1694 1697 1700 1703 1706 1709
PLUMED:  1712 1715 1718 1721 1724 1727 1730 1733 1736 1739 1742 1745 1748 1751 1754 1757 1760 1763 1766 1769 1772 1775 1778 1781 1784
PLUMED:  1787 1790 1793 1796 1799 1802 1805 1808 1811 1814 1817 1820 1823 1826 1829 1832 1835 1838 1841 1844 1847 1850 1853 1856 1859
PLUMED:  1862 1865 1868 1871 1874 1877 1880 1883 1886 1889 1892 1895 1898 1901 1904 1907 1910 1913 1916 1919 1922 1925 1928 1931 1934
PLUMED:  1937 1940 1943 1946 1949 1952 1955 1958 1961 1964 1967 1970 1973 1976 1979 1982 1985 1988 1991 1994 1997 2000 2003 2006 2009
PLUMED:  2012 2015 2018 2021 2024 2027 2030 2033 2036 2039 2042 2045 2048 2051 2054 2057 2060 2063 2066 2069 2072 2075 2078 2081 2084
PLUMED:  2087 2090 2093 2096 2099 2102 2105 2108 2111 2114 2117 2120 2123 2126 2129 2132 2135 2138 2141 2144 2147 2150 2153 2156 2159
PLUMED:  2162 2165 2168 2171 2174 2177 2180 2183 2186 2189 2192 2195 2198 2201 2204 2207 2210 2213 2216 2219 2222 2225 2228 2231 2234
PLUMED:  2237 2240 2243 2246 2249 2252 2255 2258 2261 2264 2267 2270 2273 2276 2279 2282 2285 2288 2291 2294 2297 2300 2303 2306 2309
PLUMED:  2312 2315 2318 2321 2324 2327 2330 2333 2336 2339 2342 2345 2348 2351 2354 2357 2360 2363 2366 2369 2372 2375 2378 2381 2384
PLUMED:  2387 2390 2393 2396 2399 2402 2405 2408 2411 2414 2417 2420 2423 2426 2429 2432 2435 2438 2441 2444 2447 2450 2453 2456 2459
PLUMED:  2462 2465 2468 2471 2474 2477 2480 2483 2486 2489 2492 2495 2498 2501 2504 2507 2510 2513 2516 2519 2522 2525 2528 2531 2534
PLUMED:  2537 2540 2543 2546 2549 2552 2555 2558 2561 2564 2567 2570 2573 2576 2579 2582 2585 2588 2591 2594 2597 2600 2603 2606 2609
PLUMED:  2612 2615 2618 2621 2624 2627 2630 2633 2636 2639 2642 2645 2648 2651 2654 2657 2660 2663 2666 2669 2672 2675 2678 2681 2684
PLUMED:  2687 2690 2693 2696 2699 2702 2705 2708 2711 2714 2717 2720 2723 2726 2729 2732 2735 2738 2741 2744 2747 2750 2753 2756 2759
PLUMED:  2762 2765 2768 2771 2774 2777 2780 2783 2786 2789 2792 2795 2798 2801 2804 2807 2810 2813 2816 2819 2822 2825 2828 2831 2834
PLUMED:  2837 2840 2843 2846 2849 2852 2855 2858 2861 2864 2867 2870 2873 2876 2879 2882 2885 2888 2891 2894 2897 2900 2903 2906 2909
PLUMED:  2912 2915 2918 2921 2924 2927 2930 2933 2936 2939 2942 2945 2948 2951 2954 2957 2960 2963 2966 2969 2972 2975 2978 2981 2984
PLUMED:  2987 2990 2993 2996 2999 3002 3005 3008 3011 3014 3017 3020 3023 3026 3029 3032 3035 3038 3041 3044 3047 3050 3053 3056 3059
PLUMED:  3062 3065 3068 3071 3074 3077 3080 3083 3086 3089 3092 3095 3098 3101 3104 3107 3110 3113 3116 3119 3122 3125 3128 3131 3134
PLUMED:  3137 3140 3143 3146 3149 3152 3155 3158 3161 3164 3167 3170 3173 3176 3179 3182 3185 3188 3191 3194 3197 3200 3203 3206 3209
PLUMED:  3212 3215 3218 3221 3224 3227 3230 3233 3236 3239 3242 3245 3248 3251 3254 3257 3260 3263 3266 3269 3272 3275 3278 3281 3284
PLUMED:  3287 3290 3293 3296 3299 3302 3305 3308 3311 3314 3317 3320 3323 3326 3329 3332 3335 3338 3341 3344 3347 3350 3353 3356 3359
PLUMED:  3362 3365 3368 3371 3374 3377 3380 3383 3386 3389 3392 3395 3398 3401 3404 3407 3410 3413 3416 3419 3422 3425 3428 3431 3434
PLUMED:  3437 3440 3443 3446 3449 3452 3455 3458 3461 3464 3467 3470 3473 3476 3479 3482 3485 3488 3491 3494 3497 3500 3503 3506 3509
PLUMED:  3512 3515 3518 3521 3524 3527 3530 3533 3536 3539 3542 3545 3548 3551 3554 3557 3560 3563 3566 3569 3572 3575 3578 3581 3584
PLUMED:  3587 3590 3593 3596 3599 3602 3605 3608 3611 3614 3617 3620 3623 3626 3629 3632 3635 3638 3641 3644 3647 3650 3653 3656 3659
PLUMED:  3662 3665 3668 3671 3674 3677 3680 3683 3686 3689 3692 3695 3698 3701 3704 3707 3710 3713 3716 3719 3722 3725 3728 3731 3734
PLUMED:  3737 3740 3743 3746 3749 3752 3755 3758 3761 3764 3767 3770 3773 3776 3779 3782 3785 3788 3791 3794 3797 3800 3803 3806 3809
PLUMED:  3812 3815 3818 3821 3824 3827 3830 3833 3836 3839 3842 3845 3848 3851 3854 3857 3860 3863 3866 3869 3872 3875 3878 3881 3884
PLUMED:  3887 3890 3893 3896 3899 3902 3905 3908 3911 3914 3917 3920 3923 3926 3929 3932 3935 3938 3941 3944 3947 3950 3953 3956 3959
PLUMED:  3962 3965 3968 3971 3974 3977 3980 3983 3986 3989 3992 3995 3998 4001 4004 4007 4010 4013 4016 4019 4022 4025 4028 4031 4034
PLUMED:  4037 4040 4043 4046 4049 4052 4055 4058 4061 4064 4067 4070 4073 4076 4079 4082 4085 4088 4091 4094 4097 4100 4103 4106 4109
PLUMED:  4112 4115 4118 4121 4124 4127 4130 4133 4136 4139 4142 4145 4148 4151 4154 4157 4160 4163 4166 4169 4172 4175 4178 4181 4184
PLUMED:  4187 4190 4193 4196 4199 4202 4205 4208 4211 4214 4217 4220 4223 4226 4229 4232 4235 4238 4241 4244 4247 4250 4253 4256 4259
PLUMED:  4262 4265 4268 4271 4274 4277 4280 4283 4286 4289 4292 4295 4298 4301 4304 4307 4310 4313 4316 4319 4322 4325 4328 4331 4334
PLUMED:  4337 4340 4343 4346 4349 4352 4355 4358 4361 4364 4367 4370 4373 4376 4379 4382 4385 4388 4391 4394 4397 4400 4403 4406 4409
PLUMED:  4412 4415 4418 4421 4424 4427 4430 4433 4436 4439 4442 4445 4448 4451 4454 4457 4460 4463 4466 4469 4472 4475 4478 4481 4484
PLUMED:  4487 4490 4493 4496 4499 4502 4505 4508 4511 4514 4517 4520 4523 4526 4529 4532 4535 4538 4541 4544 4547 4550 4553 4556 4559
PLUMED:  4562 4565 4568 4571 4574 4577 4580 4583 4586 4589 4592 4595 4598 4601 4604 4607 4610 4613 4616 4619 4622 4625 4628 4631 4634
PLUMED:  4637 4640 4643 4646 4649 4652 4655 4658 4661 4664 4667 4670 4673 4676 4679 4682 4685 4688 4691 4694 4697 4700 4703 4706 4709
PLUMED:  4712 4715 4718 4721 4724 4727 4730 4733 4736 4739 4742 4745 4748 4751 4754 4757 4760 4763 4766 4769 4772 4775 4778 4781 4784
PLUMED:  4787 4790 4793 4796 4799 4802 4805 4808 4811 4814 4817 4820 4823 4826 4829 4832 4835 4838 4841 4844 4847 4850 4853 4856 4859
PLUMED:  4862 4865 4868 4871 4874 4877 4880 4883 4886 4889 4892 4895 4898 4901 4904 4907 4910 4913 4916 4919 4922 4925 4928 4931 4934
PLUMED:  4937 4940 4943 4946 4949 4952 4955 4958 4961 4964 4967 4970 4973 4976 4979 4982 4985 4988 4991 4994 4997 5000 5003 5006 5009
PLUMED:  5012 5015 5018 5021 5024 5027 5030 5033 5036 5039 5042 5045 5048 5051 5054 5057 5060 5063 5066 5069 5072 5075 5078 5081 5084
PLUMED:  5087 5090 5093 5096 5099 5102 5105 5108 5111 5114 5117 5120 5123 5126 5129 5132 5135 5138 5141 5144 5147 5150 5153 5156 5159
PLUMED:  5162 5165 5168 5171 5174 5177 5180 5183 5186 5189 5192 5195 5198 5201 5204 5207 5210 5213 5216 5219 5222 5225 5228 5231 5234
PLUMED:  5237 5240 5243 5246 5249 5252 5255 5258 5261 5264 5267 5270 5273 5276 5279 5282 5285 5288 5291 5294 5297 5300 5303 5306 5309
PLUMED:  5312 5315 5318 5321 5324 5327 5330 5333 5336 5339 5342 5345 5348 5351 5354 5357 5360 5363 5366 5369 5372 5375 5378 5381 5384
PLUMED:  5387 5390 5393 5396 5399 5402 5405 5408 5411 5414 5417 5420 5423 5426 5429 5432 5435 5438 5441 5444 5447 5450 5453 5456 5459
PLUMED:  5462 5465 5468 5471 5474 5477 5480 5483 5486 5489 5492 5495 5498 5501 5504 5507 5510 5513 5516 5519 5522 5525 5528 5531 5534
PLUMED:  5537 5540 5543 5546 5549 5552 5555 5558 5561 5564 5567 5570 5573 5576 5579 5582 5585 5588 5591 5594 5597 5600 5603 5606 5609
PLUMED:  5612 5615 5618 5621 5624 5627 5630 5633 5636 5639 5642 5645 5648 5651 5654 5657 5660 5663 5666 5669 5672 5675 5678 5681 5684
PLUMED:  5687 5690 5693 5696 5699 5702 5705 5708 5711 5714 5717 5720 5723 5726 5729 5732 5735 5738 5741 5744 5747 5750 5753 5756 5759
PLUMED:  5762 5765 5768 5771 5774 5777 5780 5783 5786 5789 5792 5795 5798 5801 5804 5807 5810 5813 5816 5819 5822 5825 5828 5831 5834
PLUMED:  5837 5840 5843 5846 5849 5852 5855 5858 5861 5864 5867 5870 5873 5876 5879 5882 5885 5888 5891 5894 5897 5900 5903 5906 5909
PLUMED:  5912 5915 5918 5921 5924 5927 5930 5933 5936 5939 5942 5945 5948 5951 5954 5957 5960 5963 5966 5969 5972 5975 5978 5981 5984
PLUMED:  5987 5990 5993 5996 5999 6002 6005 6008 6011 6014 6017 6020 6023 6026 6029 6032 6035 6038 6041 6044 6047 6050 6053 6056 6059
PLUMED:  6062 6065 6068 6071 6074 6077 6080 6083 6086 6089 6092 6095 6098 6101 6104 6107 6110 6113 6116 6119 6122 6125 6128 6131 6134
PLUMED:  6137 6140 6143 6146 6149 6152 6155 6158 6161 6164 6167 6170 6173 6176 6179 6182 6185 6188 6191 6194 6197 6200 6203 6206 6209
PLUMED:  6212 6215 6218 6221 6224 6227 6230 6233 6236 6239 6242 6245 6248 6251 6254 6257 6260 6263 6266 6269 6272 6275 6278 6281 6284
PLUMED:  6287 6290 6293 6296 6299 6302 6305 6308 6311 6314 6317 6320 6323 6326 6329 6332 6335 6338 6341 6344 6347 6350 6353 6356 6359
PLUMED:  6362 6365 6368 6371 6374 6377 6380 6383 6386 6389 6392 6395 6398 6401 6404 6407 6410 6413 6416 6419 6422 6425 6428 6431 6434
PLUMED:  6437 6440 6443 6446 6449 6452 6455 6458 6461 6464 6467 6470 6473 6476 6479 6482 6485 6488 6491 6494 6497 6500 6503 6506 6509
PLUMED:  6512 6515 6518 6521 6524 6527 6530 6533 6536 6539 6542 6545 6548 6551 6554 6557 6560 6563 6566 6569 6572 6575 6578 6581 6584
PLUMED:  6587 6590 6593 6596 6599 6602 6605 6608 6611 6614 6617 6620 6623 6626 6629 6632 6635 6638 6641 6644 6647 6650 6653 6656 6659
PLUMED:  6662 6665 6668 6671 6674 6677 6680 6683 6686 6689 6692 6695 6698 6701 6704 6707 6710 6713 6716 6719 6722 6725 6728 6731 6734
PLUMED:  6737 6740 6743 6746 6749 6752 6755 6758 6761 6764 6767 6770 6773 6776 6779 6782 6785 6788 6791 6794 6797 6800 6803 6806 6809
PLUMED:  6812 6815 6818 6821 6824
PLUMED: Action WHOLEMOLECULES
PLUMED:   with label @7
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   atoms in entity 0 : 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 
PLUMED: Action FIT_TO_TEMPLATE
PLUMED:   with label @8
PLUMED:   with stride 1
PLUMED:   found 40 atoms in input 
PLUMED:   with indices : 
PLUMED: 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 
PLUMED: 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 
PLUMED:   Method chosen for fitting: OPTIMAL 
PLUMED: WARNING for action FIT_TO_TEMPLATE with label @8 : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED: Action CENTER
PLUMED:   with label lig
PLUMED: Action CENTER_FAST
PLUMED:   with label lig
PLUMED:   added component to this action:  lig.x 
PLUMED:   added component to this action:  lig.y 
PLUMED:   added component to this action:  lig.z 
PLUMED:   added component to this action:  lig.mass 
PLUMED:   added component to this action:  lig.charge 
PLUMED:   of atoms:
PLUMED:  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
PLUMED:  using the geometric center
PLUMED:   broken molecules will be rebuilt assuming atoms are in the proper order
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v1
PLUMED:   added component to this action:  v1.x 
PLUMED:   added component to this action:  v1.y 
PLUMED:   added component to this action:  v1.z 
PLUMED:   added component to this action:  v1.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v1.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v2
PLUMED:   added component to this action:  v2.x 
PLUMED:   added component to this action:  v2.y 
PLUMED:   added component to this action:  v2.z 
PLUMED:   added component to this action:  v2.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v2.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v3
PLUMED:   added component to this action:  v3.x 
PLUMED:   added component to this action:  v3.y 
PLUMED:   added component to this action:  v3.z 
PLUMED:   added component to this action:  v3.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v3.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v4
PLUMED:   added component to this action:  v4.x 
PLUMED:   added component to this action:  v4.y 
PLUMED:   added component to this action:  v4.z 
PLUMED:   added component to this action:  v4.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v4.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 2.75
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v5
PLUMED:   added component to this action:  v5.x 
PLUMED:   added component to this action:  v5.y 
PLUMED:   added component to this action:  v5.z 
PLUMED:   added component to this action:  v5.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v5.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v6
PLUMED:   added component to this action:  v6.x 
PLUMED:   added component to this action:  v6.y 
PLUMED:   added component to this action:  v6.z 
PLUMED:   added component to this action:  v6.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v6.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.25
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v7
PLUMED:   added component to this action:  v7.x 
PLUMED:   added component to this action:  v7.y 
PLUMED:   added component to this action:  v7.z 
PLUMED:   added component to this action:  v7.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v7.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.5
PLUMED: Action FIXEDATOM
PLUMED:   with label v8
PLUMED:   added component to this action:  v8.x 
PLUMED:   added component to this action:  v8.y 
PLUMED:   added component to this action:  v8.z 
PLUMED:   added component to this action:  v8.mass 
PLUMED:   added component to this action:  v8.charge 
PLUMED:   AT position 2.0136 2.0136 3.75
PLUMED: Action DISTANCE
PLUMED:   with label cyl
PLUMED:   between atoms 1000002 1000001
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   added component to this action:  cyl.x 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.y 
PLUMED:   added component to this action:  cyl.z 
PLUMED:   WARNING: components will not have the proper periodicity - see manual
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label radius
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.x 
PLUMED:    scalar with label cyl.y 
PLUMED:   with function : sqrt(x*x+y*y)
PLUMED:   with variables : x y
PLUMED:   function as parsed by lepton: sqrt((square(x))+(square(y)))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((x)+(x))
PLUMED:     (0.5*(recip(sqrt((square(x))+(square(y))))))*((y)+(y))
PLUMED:   not calculating when all arguments are zero 
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   9  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   3  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V2
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000003  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.600000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.35.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label L4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   10  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=6 mm=10
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V1
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000002  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V3
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000004  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V4
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000005  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V5
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000006  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V6
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000007  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V7
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000008  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action COORDINATION
PLUMED:   with label V8
PLUMED:   between two groups of 1 and 2205 atoms
PLUMED:   first group:
PLUMED:   1000009  
PLUMED:   second group:
PLUMED:   212  215  218  221  224  227  230  233  236  239  242  245  248  251  254  257  260  263  266  269  272  275  278  281  
PLUMED:   284  287  290  293  296  299  302  305  308  311  314  317  320  323  326  329  332  335  338  341  344  347  350  353  356  
PLUMED:   359  362  365  368  371  374  377  380  383  386  389  392  395  398  401  404  407  410  413  416  419  422  425  428  431  
PLUMED:   434  437  440  443  446  449  452  455  458  461  464  467  470  473  476  479  482  485  488  491  494  497  500  503  506  
PLUMED:   509  512  515  518  521  524  527  530  533  536  539  542  545  548  551  554  557  560  563  566  569  572  575  578  581  
PLUMED:   584  587  590  593  596  599  602  605  608  611  614  617  620  623  626  629  632  635  638  641  644  647  650  653  656  
PLUMED:   659  662  665  668  671  674  677  680  683  686  689  692  695  698  701  704  707  710  713  716  719  722  725  728  731  
PLUMED:   734  737  740  743  746  749  752  755  758  761  764  767  770  773  776  779  782  785  788  791  794  797  800  803  806  
PLUMED:   809  812  815  818  821  824  827  830  833  836  839  842  845  848  851  854  857  860  863  866  869  872  875  878  881  
PLUMED:   884  887  890  893  896  899  902  905  908  911  914  917  920  923  926  929  932  935  938  941  944  947  950  953  956  
PLUMED:   959  962  965  968  971  974  977  980  983  986  989  992  995  998  1001  1004  1007  1010  1013  1016  1019  1022  1025  1028  1031  
PLUMED:   1034  1037  1040  1043  1046  1049  1052  1055  1058  1061  1064  1067  1070  1073  1076  1079  1082  1085  1088  1091  1094  1097  1100  1103  1106  
PLUMED:   1109  1112  1115  1118  1121  1124  1127  1130  1133  1136  1139  1142  1145  1148  1151  1154  1157  1160  1163  1166  1169  1172  1175  1178  1181  
PLUMED:   1184  1187  1190  1193  1196  1199  1202  1205  1208  1211  1214  1217  1220  1223  1226  1229  1232  1235  1238  1241  1244  1247  1250  1253  1256  
PLUMED:   1259  1262  1265  1268  1271  1274  1277  1280  1283  1286  1289  1292  1295  1298  1301  1304  1307  1310  1313  1316  1319  1322  1325  1328  1331  
PLUMED:   1334  1337  1340  1343  1346  1349  1352  1355  1358  1361  1364  1367  1370  1373  1376  1379  1382  1385  1388  1391  1394  1397  1400  1403  1406  
PLUMED:   1409  1412  1415  1418  1421  1424  1427  1430  1433  1436  1439  1442  1445  1448  1451  1454  1457  1460  1463  1466  1469  1472  1475  1478  1481  
PLUMED:   1484  1487  1490  1493  1496  1499  1502  1505  1508  1511  1514  1517  1520  1523  1526  1529  1532  1535  1538  1541  1544  1547  1550  1553  1556  
PLUMED:   1559  1562  1565  1568  1571  1574  1577  1580  1583  1586  1589  1592  1595  1598  1601  1604  1607  1610  1613  1616  1619  1622  1625  1628  1631  
PLUMED:   1634  1637  1640  1643  1646  1649  1652  1655  1658  1661  1664  1667  1670  1673  1676  1679  1682  1685  1688  1691  1694  1697  1700  1703  1706  
PLUMED:   1709  1712  1715  1718  1721  1724  1727  1730  1733  1736  1739  1742  1745  1748  1751  1754  1757  1760  1763  1766  1769  1772  1775  1778  1781  
PLUMED:   1784  1787  1790  1793  1796  1799  1802  1805  1808  1811  1814  1817  1820  1823  1826  1829  1832  1835  1838  1841  1844  1847  1850  1853  1856  
PLUMED:   1859  1862  1865  1868  1871  1874  1877  1880  1883  1886  1889  1892  1895  1898  1901  1904  1907  1910  1913  1916  1919  1922  1925  1928  1931  
PLUMED:   1934  1937  1940  1943  1946  1949  1952  1955  1958  1961  1964  1967  1970  1973  1976  1979  1982  1985  1988  1991  1994  1997  2000  2003  2006  
PLUMED:   2009  2012  2015  2018  2021  2024  2027  2030  2033  2036  2039  2042  2045  2048  2051  2054  2057  2060  2063  2066  2069  2072  2075  2078  2081  
PLUMED:   2084  2087  2090  2093  2096  2099  2102  2105  2108  2111  2114  2117  2120  2123  2126  2129  2132  2135  2138  2141  2144  2147  2150  2153  2156  
PLUMED:   2159  2162  2165  2168  2171  2174  2177  2180  2183  2186  2189  2192  2195  2198  2201  2204  2207  2210  2213  2216  2219  2222  2225  2228  2231  
PLUMED:   2234  2237  2240  2243  2246  2249  2252  2255  2258  2261  2264  2267  2270  2273  2276  2279  2282  2285  2288  2291  2294  2297  2300  2303  2306  
PLUMED:   2309  2312  2315  2318  2321  2324  2327  2330  2333  2336  2339  2342  2345  2348  2351  2354  2357  2360  2363  2366  2369  2372  2375  2378  2381  
PLUMED:   2384  2387  2390  2393  2396  2399  2402  2405  2408  2411  2414  2417  2420  2423  2426  2429  2432  2435  2438  2441  2444  2447  2450  2453  2456  
PLUMED:   2459  2462  2465  2468  2471  2474  2477  2480  2483  2486  2489  2492  2495  2498  2501  2504  2507  2510  2513  2516  2519  2522  2525  2528  2531  
PLUMED:   2534  2537  2540  2543  2546  2549  2552  2555  2558  2561  2564  2567  2570  2573  2576  2579  2582  2585  2588  2591  2594  2597  2600  2603  2606  
PLUMED:   2609  2612  2615  2618  2621  2624  2627  2630  2633  2636  2639  2642  2645  2648  2651  2654  2657  2660  2663  2666  2669  2672  2675  2678  2681  
PLUMED:   2684  2687  2690  2693  2696  2699  2702  2705  2708  2711  2714  2717  2720  2723  2726  2729  2732  2735  2738  2741  2744  2747  2750  2753  2756  
PLUMED:   2759  2762  2765  2768  2771  2774  2777  2780  2783  2786  2789  2792  2795  2798  2801  2804  2807  2810  2813  2816  2819  2822  2825  2828  2831  
PLUMED:   2834  2837  2840  2843  2846  2849  2852  2855  2858  2861  2864  2867  2870  2873  2876  2879  2882  2885  2888  2891  2894  2897  2900  2903  2906  
PLUMED:   2909  2912  2915  2918  2921  2924  2927  2930  2933  2936  2939  2942  2945  2948  2951  2954  2957  2960  2963  2966  2969  2972  2975  2978  2981  
PLUMED:   2984  2987  2990  2993  2996  2999  3002  3005  3008  3011  3014  3017  3020  3023  3026  3029  3032  3035  3038  3041  3044  3047  3050  3053  3056  
PLUMED:   3059  3062  3065  3068  3071  3074  3077  3080  3083  3086  3089  3092  3095  3098  3101  3104  3107  3110  3113  3116  3119  3122  3125  3128  3131  
PLUMED:   3134  3137  3140  3143  3146  3149  3152  3155  3158  3161  3164  3167  3170  3173  3176  3179  3182  3185  3188  3191  3194  3197  3200  3203  3206  
PLUMED:   3209  3212  3215  3218  3221  3224  3227  3230  3233  3236  3239  3242  3245  3248  3251  3254  3257  3260  3263  3266  3269  3272  3275  3278  3281  
PLUMED:   3284  3287  3290  3293  3296  3299  3302  3305  3308  3311  3314  3317  3320  3323  3326  3329  3332  3335  3338  3341  3344  3347  3350  3353  3356  
PLUMED:   3359  3362  3365  3368  3371  3374  3377  3380  3383  3386  3389  3392  3395  3398  3401  3404  3407  3410  3413  3416  3419  3422  3425  3428  3431  
PLUMED:   3434  3437  3440  3443  3446  3449  3452  3455  3458  3461  3464  3467  3470  3473  3476  3479  3482  3485  3488  3491  3494  3497  3500  3503  3506  
PLUMED:   3509  3512  3515  3518  3521  3524  3527  3530  3533  3536  3539  3542  3545  3548  3551  3554  3557  3560  3563  3566  3569  3572  3575  3578  3581  
PLUMED:   3584  3587  3590  3593  3596  3599  3602  3605  3608  3611  3614  3617  3620  3623  3626  3629  3632  3635  3638  3641  3644  3647  3650  3653  3656  
PLUMED:   3659  3662  3665  3668  3671  3674  3677  3680  3683  3686  3689  3692  3695  3698  3701  3704  3707  3710  3713  3716  3719  3722  3725  3728  3731  
PLUMED:   3734  3737  3740  3743  3746  3749  3752  3755  3758  3761  3764  3767  3770  3773  3776  3779  3782  3785  3788  3791  3794  3797  3800  3803  3806  
PLUMED:   3809  3812  3815  3818  3821  3824  3827  3830  3833  3836  3839  3842  3845  3848  3851  3854  3857  3860  3863  3866  3869  3872  3875  3878  3881  
PLUMED:   3884  3887  3890  3893  3896  3899  3902  3905  3908  3911  3914  3917  3920  3923  3926  3929  3932  3935  3938  3941  3944  3947  3950  3953  3956  
PLUMED:   3959  3962  3965  3968  3971  3974  3977  3980  3983  3986  3989  3992  3995  3998  4001  4004  4007  4010  4013  4016  4019  4022  4025  4028  4031  
PLUMED:   4034  4037  4040  4043  4046  4049  4052  4055  4058  4061  4064  4067  4070  4073  4076  4079  4082  4085  4088  4091  4094  4097  4100  4103  4106  
PLUMED:   4109  4112  4115  4118  4121  4124  4127  4130  4133  4136  4139  4142  4145  4148  4151  4154  4157  4160  4163  4166  4169  4172  4175  4178  4181  
PLUMED:   4184  4187  4190  4193  4196  4199  4202  4205  4208  4211  4214  4217  4220  4223  4226  4229  4232  4235  4238  4241  4244  4247  4250  4253  4256  
PLUMED:   4259  4262  4265  4268  4271  4274  4277  4280  4283  4286  4289  4292  4295  4298  4301  4304  4307  4310  4313  4316  4319  4322  4325  4328  4331  
PLUMED:   4334  4337  4340  4343  4346  4349  4352  4355  4358  4361  4364  4367  4370  4373  4376  4379  4382  4385  4388  4391  4394  4397  4400  4403  4406  
PLUMED:   4409  4412  4415  4418  4421  4424  4427  4430  4433  4436  4439  4442  4445  4448  4451  4454  4457  4460  4463  4466  4469  4472  4475  4478  4481  
PLUMED:   4484  4487  4490  4493  4496  4499  4502  4505  4508  4511  4514  4517  4520  4523  4526  4529  4532  4535  4538  4541  4544  4547  4550  4553  4556  
PLUMED:   4559  4562  4565  4568  4571  4574  4577  4580  4583  4586  4589  4592  4595  4598  4601  4604  4607  4610  4613  4616  4619  4622  4625  4628  4631  
PLUMED:   4634  4637  4640  4643  4646  4649  4652  4655  4658  4661  4664  4667  4670  4673  4676  4679  4682  4685  4688  4691  4694  4697  4700  4703  4706  
PLUMED:   4709  4712  4715  4718  4721  4724  4727  4730  4733  4736  4739  4742  4745  4748  4751  4754  4757  4760  4763  4766  4769  4772  4775  4778  4781  
PLUMED:   4784  4787  4790  4793  4796  4799  4802  4805  4808  4811  4814  4817  4820  4823  4826  4829  4832  4835  4838  4841  4844  4847  4850  4853  4856  
PLUMED:   4859  4862  4865  4868  4871  4874  4877  4880  4883  4886  4889  4892  4895  4898  4901  4904  4907  4910  4913  4916  4919  4922  4925  4928  4931  
PLUMED:   4934  4937  4940  4943  4946  4949  4952  4955  4958  4961  4964  4967  4970  4973  4976  4979  4982  4985  4988  4991  4994  4997  5000  5003  5006  
PLUMED:   5009  5012  5015  5018  5021  5024  5027  5030  5033  5036  5039  5042  5045  5048  5051  5054  5057  5060  5063  5066  5069  5072  5075  5078  5081  
PLUMED:   5084  5087  5090  5093  5096  5099  5102  5105  5108  5111  5114  5117  5120  5123  5126  5129  5132  5135  5138  5141  5144  5147  5150  5153  5156  
PLUMED:   5159  5162  5165  5168  5171  5174  5177  5180  5183  5186  5189  5192  5195  5198  5201  5204  5207  5210  5213  5216  5219  5222  5225  5228  5231  
PLUMED:   5234  5237  5240  5243  5246  5249  5252  5255  5258  5261  5264  5267  5270  5273  5276  5279  5282  5285  5288  5291  5294  5297  5300  5303  5306  
PLUMED:   5309  5312  5315  5318  5321  5324  5327  5330  5333  5336  5339  5342  5345  5348  5351  5354  5357  5360  5363  5366  5369  5372  5375  5378  5381  
PLUMED:   5384  5387  5390  5393  5396  5399  5402  5405  5408  5411  5414  5417  5420  5423  5426  5429  5432  5435  5438  5441  5444  5447  5450  5453  5456  
PLUMED:   5459  5462  5465  5468  5471  5474  5477  5480  5483  5486  5489  5492  5495  5498  5501  5504  5507  5510  5513  5516  5519  5522  5525  5528  5531  
PLUMED:   5534  5537  5540  5543  5546  5549  5552  5555  5558  5561  5564  5567  5570  5573  5576  5579  5582  5585  5588  5591  5594  5597  5600  5603  5606  
PLUMED:   5609  5612  5615  5618  5621  5624  5627  5630  5633  5636  5639  5642  5645  5648  5651  5654  5657  5660  5663  5666  5669  5672  5675  5678  5681  
PLUMED:   5684  5687  5690  5693  5696  5699  5702  5705  5708  5711  5714  5717  5720  5723  5726  5729  5732  5735  5738  5741  5744  5747  5750  5753  5756  
PLUMED:   5759  5762  5765  5768  5771  5774  5777  5780  5783  5786  5789  5792  5795  5798  5801  5804  5807  5810  5813  5816  5819  5822  5825  5828  5831  
PLUMED:   5834  5837  5840  5843  5846  5849  5852  5855  5858  5861  5864  5867  5870  5873  5876  5879  5882  5885  5888  5891  5894  5897  5900  5903  5906  
PLUMED:   5909  5912  5915  5918  5921  5924  5927  5930  5933  5936  5939  5942  5945  5948  5951  5954  5957  5960  5963  5966  5969  5972  5975  5978  5981  
PLUMED:   5984  5987  5990  5993  5996  5999  6002  6005  6008  6011  6014  6017  6020  6023  6026  6029  6032  6035  6038  6041  6044  6047  6050  6053  6056  
PLUMED:   6059  6062  6065  6068  6071  6074  6077  6080  6083  6086  6089  6092  6095  6098  6101  6104  6107  6110  6113  6116  6119  6122  6125  6128  6131  
PLUMED:   6134  6137  6140  6143  6146  6149  6152  6155  6158  6161  6164  6167  6170  6173  6176  6179  6182  6185  6188  6191  6194  6197  6200  6203  6206  
PLUMED:   6209  6212  6215  6218  6221  6224  6227  6230  6233  6236  6239  6242  6245  6248  6251  6254  6257  6260  6263  6266  6269  6272  6275  6278  6281  
PLUMED:   6284  6287  6290  6293  6296  6299  6302  6305  6308  6311  6314  6317  6320  6323  6326  6329  6332  6335  6338  6341  6344  6347  6350  6353  6356  
PLUMED:   6359  6362  6365  6368  6371  6374  6377  6380  6383  6386  6389  6392  6395  6398  6401  6404  6407  6410  6413  6416  6419  6422  6425  6428  6431  
PLUMED:   6434  6437  6440  6443  6446  6449  6452  6455  6458  6461  6464  6467  6470  6473  6476  6479  6482  6485  6488  6491  6494  6497  6500  6503  6506  
PLUMED:   6509  6512  6515  6518  6521  6524  6527  6530  6533  6536  6539  6542  6545  6548  6551  6554  6557  6560  6563  6566  6569  6572  6575  6578  6581  
PLUMED:   6584  6587  6590  6593  6596  6599  6602  6605  6608  6611  6614  6617  6620  6623  6626  6629  6632  6635  6638  6641  6644  6647  6650  6653  6656  
PLUMED:   6659  6662  6665  6668  6671  6674  6677  6680  6683  6686  6689  6692  6695  6698  6701  6704  6707  6710  6713  6716  6719  6722  6725  6728  6731  
PLUMED:   6734  6737  6740  6743  6746  6749  6752  6755  6758  6761  6764  6767  6770  6773  6776  6779  6782  6785  6788  6791  6794  6797  6800  6803  6806  
PLUMED:   6809  6812  6815  6818  6821  6824  
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED:   using neighbor lists with
PLUMED:   update every 20 steps and cutoff 1.500000
PLUMED:   contacts are counted with cutoff 0.25.  Using rational switching function with parameters d0=0 nn=2 mm=6
PLUMED: Action ANGLE
PLUMED:   with label ang
PLUMED:   between lines 1000004-1000006 and 8-10
PLUMED:   using periodic boundary conditions
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label cosang
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label ang 
PLUMED:   with function : cos(x)
PLUMED:   with variables : x
PLUMED:   function as parsed by lepton: cos(x)
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     -(sin(x))
PLUMED: Action MATHEVAL
PLUMED:   with label funnel
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   with function : (r+1.0*(-1.2+z))*step(-z+1.)+(r-0.2)*step(z-1.)
PLUMED:   with variables : r z
PLUMED:   function as parsed by lepton: (((r)+(-1.2+(z)))*(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(step(-1+(z))))
PLUMED:   derivatives as computed by lepton:
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+(((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))+(step(-1+(z))))
PLUMED:     ((((r)+(-1.2+(z)))*(delta(1+(-(z)))))+(step(1+(-(z)))))+((-0.2+(r))*(delta(-1+(z))))
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label funnelwall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label funnel 
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.bias 
PLUMED:   at 0.000000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 2000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  funnelwall.force2 
PLUMED: Action UPPER_WALLS
PLUMED:   with label upper_wall
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.bias 
PLUMED:   at 1.800000
PLUMED:   with an offset 0.000000
PLUMED:   with force constant 4000.000000
PLUMED:   and exponent 2.000000
PLUMED:   rescaled 1.000000
PLUMED:   added component to this action:  upper_wall.force2 
PLUMED: Action ENERGY
PLUMED:   with label ene
PLUMED: WARNING for action ENERGY with label ene : documentation for the value calculated by this action has not been included 
PLUMED:   Bibliography [3][4]
PLUMED: Action OPES_METAD_EXPLORE
PLUMED:   with label opes
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:   added component to this action:  opes.bias 
PLUMED:  +++ WARNING +++ the provided STATE_RFILE will be ignored, since RESTART was not requested
PLUMED:   added component to this action:  opes.rct 
PLUMED:   added component to this action:  opes.zed 
PLUMED:   added component to this action:  opes.neff 
PLUMED:   added component to this action:  opes.nker 
PLUMED:   temperature = 299.478
PLUMED:   beta = 0.401606
PLUMED:   depositing new kernels with PACE = 10000
PLUMED:   expected BARRIER is 50
PLUMED:   using target distribution with BIASFACTOR gamma = 20.0803
PLUMED:   adaptive SIGMA will be used, with ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE = 100000
PLUMED:     thus the first x kernel depositions will be skipped, x = ADAPTIVE_SIGMA_STRIDE/PACE = 10
PLUMED:   kernels are truncated with KERNELS_CUTOFF = 6.33724
PLUMED:   the value at cutoff is = 1.90207e-09
PLUMED:   regularization EPSILON = 0.349095
PLUMED:   kernels will be compressed when closer than COMPRESSION_THRESHOLD = 1
PLUMED:   state checkpoints are written on file compressed.Kernels.data only on CPT events (or never if MD code does define them!)
PLUMED:   Bibliography: [5][6]
PLUMED: Action PRINT
PLUMED:   with label @46
PLUMED:   with stride 500
PLUMED:   with arguments : 
PLUMED:    scalar with label opes.bias 
PLUMED:    scalar with label cyl.z 
PLUMED:    scalar with label radius 
PLUMED:    scalar with label funnelwall.bias 
PLUMED:    scalar with label upper_wall.bias 
PLUMED:    scalar with label ene 
PLUMED:    scalar with label cosang 
PLUMED:    scalar with label L1 
PLUMED:    scalar with label L2 
PLUMED:    scalar with label L3 
PLUMED:    scalar with label L4 
PLUMED:    scalar with label V1 
PLUMED:    scalar with label V2 
PLUMED:    scalar with label V3 
PLUMED:    scalar with label V4 
PLUMED:    scalar with label V5 
PLUMED:    scalar with label V6 
PLUMED:    scalar with label V7 
PLUMED:    scalar with label V8 
PLUMED:   on file COLVAR
PLUMED:   with format  %8.4f
PLUMED: END FILE: plumed.dat
PLUMED: Timestep: 1.000000
PLUMED: KbT: 2.490000
PLUMED: Relevant bibliography:
PLUMED:   [1] The PLUMED consortium, Nat. Methods 16, 670 (2019)
PLUMED:   [2] Tribello, Bonomi, Branduardi, Camilloni, and Bussi, Comput. Phys. Commun. 185, 604 (2014)
PLUMED:   [3] Bartels and Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 865 (1998)
PLUMED:   [4] Bonomi and Parrinello, J. Comp. Chem. 30, 1615 (2009)
PLUMED:   [5] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Phys. Chem. Lett. 11, 2731-2736 (2020)
PLUMED:   [6] M. Invernizzi and M. Parrinello, J. Chem. Theory Comput. 18, 3988-3996 (2022)
PLUMED: Please read and cite where appropriate!
PLUMED: Finished setup
PLUMED:                                               Cycles        Total      Average      Minimum      Maximum
PLUMED:                                                    1     0.043377     0.043377     0.043377     0.043377
